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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001890`

染色体: Chr03 坐标: 26385874-26387514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001890`
名称	SmilChr03G001890
描述	uncharacterized SmilChr03G001890
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26385874 - 26387514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018595`
GeneID	`131018595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018595`
原始查询	`LOC131018595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=26.9; qcov=0.17; evalue=1.49e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803290.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803290.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803290.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803290.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26385902`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr3:26385902`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B42
`Chr3:26385905`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B42
`Chr3:26385905`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B42
`Chr3:26385921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr3:26385922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C32
`Chr3:26385936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B96
`Chr3:26385936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr3:26385985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B99,C64
`Chr3:26386007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:26386008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:26386048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B85,B9,C33,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803290.1

546 aa

273

546

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 247-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803290.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	247	337	1.2e-06	29.9	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947307.1
ATGCAGCAGGGGAATTTTCAACAGCAGCAGCAGCAATTTCAGACTGCTCCCCAACAGTTTCAGAAGCAAGCCCAACCACAGAAGCCGACTCTCGAGGACACCATGCAATCTTTTATGGAGATGACCAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGACGCTCCATGGACAAGGATTGCAGCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018595
ATGCAGCAGGGGAATTTTCAACAGCAGCAGCAGCAATTTCAGACTGCTCCCCAACAGTTTCAGAAGCAAGCCCAACCACAGAAGCCGACTCTCGAGGACACCATGCAATCTTTTATGGAGATGACCAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGACGCTCCATGGACAAGGATTGCAGCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803290.1
MQQGNFQQQQQQFQTAPQQFQKQAQPQKPTLEDTMQSFMEMTKQSMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQMQQQQQPGTLHGQGLQPHQAQAVTVLRNGKVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLQPREEEKEKEKEPEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIKNVPAYVKFFKELTSKKRKFVDNEKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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