当前解析结果
SmilChr03G001907| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001907 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001907 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001907 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 26690806 - 26691552 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018601 |
|---|---|
| GeneID | 131018601 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018601 |
| 原始查询 | LOC131018601 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018601 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803296.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057803296.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057803296.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057803296.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803296.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:26690819 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B45,C63,D9 |
Chr3:26690850 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:26690866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B139,B70,C50 |
Chr3:26690880 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B68,B92,C62 |
Chr3:26690891 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B57 |
Chr3:26690898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,C14,C31 |
Chr3:26690931 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr3:26690946 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,C29 |
Chr3:26690954 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A4,B43,C23,C64,C67 |
Chr3:26690954 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A4,B43,C23,C64,C67 |
Chr3:26690959 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B43,B81,B88,D6 |
Chr3:26690965 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A14,B100,B119,B128,B132,B19,B2,B37,C10,C5,C56,C58,C61,C71,C77,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。