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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001956`

染色体: Chr03 坐标: 27967326-27967778 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001956`
名称	SmilChr03G001956
描述	uncharacterized SmilChr03G001956
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27967326 - 27967778 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018613`
GeneID	`131018613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018613`
原始查询	`LOC131018613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803311.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803311.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803311.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803311.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27967340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B112,B77,C50
`Chr3:27967364`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	70	A11,A14,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A7,A9,B1,B101,B105,B108,B109,B115,B117,B119,B123,B125,B128,B130,B135,B136,B21,B23,B35,B4,B40,B41,B46,B57,B58,B61,B67,B7,B70,B76,B78,B8,B80,B89,B90,B93,B94,C11,C13,C18,C19,C21,C23,C31,C37,C42,C43,C46,C47,C48,C49,C50,C61,C69,C70,C78,C83,C86,D3,D4,D6,D9
`Chr3:27967388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,C11,C57,C70
`Chr3:27967434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:27967446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	B106,B20,B3,B38,B39,B47,B69,C1,C16,C3,C41,C56,C59
`Chr3:27967450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B91,C28
`Chr3:27967450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C28
`Chr3:27967456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B97
`Chr3:27967483`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	9	A20,B111,B120,B28,B30,C32,C38,C68,D3
`Chr3:27967541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,C12,C38,C71,D11
`Chr3:27967572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B108,C36
`Chr3:27967572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803311.1

150 aa

150

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 19-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803311.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	19	65	1.7e-09	38.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947328.1
ATGGATCCGATGACCCGGAGGTACACATGGCCAGATTTGAAAACCATGATCACGCTACATCAGTACACAGAGGGGATTAAGTGTAGAATCTTCTCTATTACGTTAACCGGAATAGCTCAGCAGTGGTTCCGGGCTCTGGAGCCTGATTCTGTTCATTCTTTTAAACAACTACATGATACGTTCATGTGGCAGTTTGCGAGCTCTAAGTGCGCTGCCATGACTGCCATGTCATTGATGGATTTAAAACAAGAACCTACCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018613
ATGGATCCGATGACCCGGAGGTACACATGGCCAGATTTGAAAACCATGATCACGCTACATCAGTACACAGAGGGGATTAAGTGTAGAATCTTCTCTATTACGTTAACCGGAATAGCTCAGCAGTGGTTCCGGGCTCTGGAGCCTGATTCTGTTCATTCTTTTAAACAACTACATGATACGTTCATGTGGCAGTTTGCGAGCTCTAAGTGCGCTGCCATGACTGCCATGTCATTGATGGATTTAAAACAAGAACCTACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803311.1
MDPMTRRYTWPDLKTMITLHQYTEGIKCRIFSITLTGIAQQWFRALEPDSVHSFKQLHDTFMWQFASSKCAAMTAMSLMDLKQEPTETLKEFAARFTKASLEVLKAESQIKGYAFVRRLRPGAFFDNLQVKQPRDFDDILALGVHTTGGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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