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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001961`

染色体: Chr03 坐标: 28109699-28110847 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001961`
名称	SmilChr03G001961
描述	uncharacterized SmilChr03G001961
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28109699 - 28110847 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018617`
GeneID	`131018617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018617`
原始查询	`LOC131018617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28.2; qcov=0.704; evalue=3.99e-29; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=22.8; qcov=0.495; evalue=4.44e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803314.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057803314.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057803314.1`
4	P-body	P-body	0.20000	`XP_057803314.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28109709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C3
`Chr3:28109726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C82
`Chr3:28109737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:28109746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,C16,C26,C7,D2
`Chr3:28109834`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr3:28109834`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr3:28109869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:28109913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:28109941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28109963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:28109971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B78,C2
`Chr3:28109975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803314.1

382 aa

191

382

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 304-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803314.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	304	333	4.1e-06	27.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947331.1
ATGTCTGCGCCGCCGTCCACCCGCCCTCCGGCTGGTAACAGTCGTCGGAGCACAACCTCTTTGAGTGCCCCGCCTAAGTCTAATGTGCAACAGACCACTTCCAATCCCTCGACAGAAACACGCATGGTAAACCCTACCCTCAACAACATTCAAACCTTCGAGAATGATGGCGTCCCAAACAACAGTTCCACATCAAACATGGACCCTCTGGCACCTGGTAACAGGCTGTCAAACCCTAGCAACGAAACTTCTCTAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018617
ATGTCTGCGCCGCCGTCCACCCGCCCTCCGGCTGGTAACAGTCGTCGGAGCACAACCTCTTTGAGTGCCCCGCCTAAGTCTAATGTGCAACAGACCACTTCCAATCCCTCGACAGAAACACGCATGGTAAACCCTACCCTCAACAACATTCAAACCTTCGAGAATGATGGCGTCCCAAACAACAGTTCCACATCAAACATGGACCCTCTGGCACCTGGTAACAGGCTGTCAAACCCTAGCAACGAAACTTCTCTAAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803314.1
MSAPPSTRPPAGNSRRSTTSLSAPPKSNVQQTTSNPSTETRMVNPTLNNIQTFENDGVPNNSSTSNMDPLAPGNRLSNPSNETSLKETGETAAKPSFAAVTAPKYVRKPDIIAHRYNRFQPERTGDTYTITIPMDFYEQQVQNFKHAVIARLLLRKGDKPRSTEDLKQELQLLWNVKGQWTLIPMGKGFFTLKFSTSEDKVAAKRHAVWDLSRGSIRIREWIRNFDPYKEVSSLCQVWVRIYNLPVEYWHAEVISAIGRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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