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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001962`

染色体: Chr03 坐标: 28111620-28116633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001962`
名称	SmilChr03G001962
描述	uncharacterized SmilChr03G001962
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28111620 - 28116633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018618`
GeneID	`131018618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018618`
原始查询	`LOC131018618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27; qcov=0.251; evalue=1.09e-39; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.6; qcov=0.508; evalue=1.39e-100; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803315.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803315.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803315.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28111656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28111660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28111665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B78,C17,C74
`Chr3:28111673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B29,B41,C45,C61
`Chr3:28111697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B35,B55,C1
`Chr3:28111710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A20,A24,A5,B105,B138,B49,B51,B54,B71,B81,B99,C43,C44,C49,C75,C87,D1,D7,D9
`Chr3:28111739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B106,B54,C15,C37
`Chr3:28111739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B54,C15,C37
`Chr3:28111783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:28111785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:28111792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B18,B61,C4
`Chr3:28111819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803315.1

1625 aa

812

1625

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 470-731 aa PF13966 zf-RVT 989-1066 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803315.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	470	731	2.4e-29	103.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803315.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	989	1066	4.3e-15	56.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947332.1
ATGGTTGGTATTATTGAGCCTAAGTCTGCTTTCAATCGTGCTTCGGTTCCGTACTGGAGGGCCATCAACTTGGTTCCGATTCATCAAAACCAAAGAACAGATATGTGCTCTAACATCTGGATTTTTGCAAATCCTAATCTCACTTTTCAAATCATTTTTTCCTCTGATCAAACTGTTATCATCGACTGCATTTGGCAGGGTTTTGATTACAGGGTGGCGTTCGTTCACGGTGCTAATTCTCATCAGATGAGACGTCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018618
ATGGTTGGTATTATTGAGCCTAAGTCTGCTTTCAATCGTGCTTCGGTTCCGTACTGGAGGGCCATCAACTTGGTTCCGATTCATCAAAACCAAAGAACAGATATGTGCTCTAACATCTGGATTTTTGCAAATCCTAATCTCACTTTTCAAATCATTTTTTCCTCTGATCAAACTGTTATCATCGACTGCATTTGGCAGGGTTTTGATTACAGGGTGGCGTTCGTTCACGGTGCTAATTCTCATCAGATGAGACGTCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803315.1
MVGIIEPKSAFNRASVPYWRAINLVPIHQNQRTDMCSNIWIFANPNLTFQIIFSSDQTVIIDCIWQGFDYRVAFVHGANSHQMRRQMWIDLLGYLNEYYVIIGDFNAVKGAHERISTCMPAAAACKDFCDFIDYSGLVESPTTGLRFTWSGRRFMPSHVESILDRAFYTASFADHWQSVHTHVFPRITSDHSPIALMCQQTNNIQRRFFKFLNMWTEHPEFSDLVTSSWTGTTAASCPIYTVMSKLKRLRKDITAWNRTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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