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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001979`

染色体: Chr03 坐标: 28723384-28731521 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001979`
名称	SmilChr03G001979
描述	uncharacterized SmilChr03G001979
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28723384 - 28731521 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018623`
GeneID	`131018623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018623`
原始查询	`LOC131018623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803321.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057803321.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057803321.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803321.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28723414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:28723423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28723429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C7,D11
`Chr3:28723432`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A22,B1,B113,B119,B35,B49,B51,B91,B94,B98,C38,C49,C70
`Chr3:28723455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B67
`Chr3:28723473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28723482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28723487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:28723496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B71
`Chr3:28723508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:28723520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A11,A18,A22,A23,A24,A7,A8,A9,B100,B105,B112,B113,B121,B125,B132,B134,B135,B137,B23,B38,B39,B45,B47,B48,B58,B62,B67,B83,B84,B87,B88,C14,C20,C25,C28,C3,C33,C34,C39,C4,C46,C47,C53,C56,C59,C60,C63,C65,C67,C72,C8,C80,C84,C86,D1,D3,D4,D9
`Chr3:28723532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B126,B28,C6,D9

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947338.1
TAACGGTATAGCATTTTGATTTGCAGACATGTCTTGGAGGAAGAAGTGCGGGGACAATCTGCCCACTATTGCTTCTCCTGTTCCCAGTGGGGAGCATGGTACTGGGGGTTCTGCTTCTGGGACAGGCCCCTCAGAACAGCCAATTGGGGCCGAGCCGGTCGCCCTCCCTCCTGTGGTAGAAGTCCCAGAGGGAAATGTGGAAGTCTCACGCCCCTTTGATGCCGAGGGGGTTGATGCGGGTAGCCTTATTCATAGGCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018623
ATGTCTTGGAGGAAGAAGTGCGGGGACAATCTGCCCACTATTGCTTCTCCTGTTCCCAGTGGGGAGCATGGTACTGGGGGTTCTGCTTCTGGGACAGGCCCCTCAGAACAGCCAATTGGGGCCGAGCCGGTCGCCCTCCCTCCTGTGGTAGAAGTCCCAGAGGGAAATGTGGAAGTCTCACGCCCCTTTGATGCCGAGGGGGTTGATGCGGGTAGCCTTATTCATAGGCGTGGCCGCTCCCACGCTGGTGATACATCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803321.1
MSWRKKCGDNLPTIASPVPSGEHGTGGSASGTGPSEQPIGAEPVALPPVVEVPEGNVEVSRPFDAEGVDAGSLIHRRGRSHAGDTSGADEGDVQIVDITDEVPSPDSVPGVTLSELSKKRKRGSLISVGEKERQADLKKASKSPEPAKKSAGGSKVLSSAMEKGKGPAKKSAGSSKVPASAGGKGKGKSVVSPADEPADVVPGPISSLSGQGLIDALIARVHSKDQEKVEQLPRGALATQLCQLALQVEARMWGAVKCIH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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