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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002023`

染色体: Chr03 坐标: 30310880-30312451 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002023`
名称	SmilChr03G002023
描述	uncharacterized SmilChr03G002023
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	30310880 - 30312451 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018640`
GeneID	`131018640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018640`
原始查询	`LOC131018640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=39.1; qcov=0.132; evalue=4.09e-07; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=29.8; qcov=0.18; evalue=1.11e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803338.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057803338.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803338.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803338.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:30310927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C4
`Chr3:30310937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:30310945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B63
`Chr3:30310958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B40,B63,C63,C7
`Chr3:30310963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:30310967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B40,B63,C63,C7
`Chr3:30310971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:30310975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:30310978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B78,C5
`Chr3:30310979`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B136,B41,C28
`Chr3:30310979`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B136,B41,C28
`Chr3:30310997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B135,B45,C25,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947355.1
ATGGCCGAGGAATCAAGGGATGAGGAAGGAACAATAGTCAGAACTGCTCCGACACCAAACCCTTCTGCCCAAGACGATAAATTGGATAAGCTATGCAACATGTTTGAGAAATTCATGACGAACCAAGGAACATCCAACCAAGGGACCCCCAACATCCGAAAACCTGTGAAGACATGCCAACTTTGCATTGCAAATTCACATGCAACTGATGAATGCCCACAATTGTTCGAAGATGAAGAACTTAATGCCATTGGGCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018640
ATGGCCGAGGAATCAAGGGATGAGGAAGGAACAATAGTCAGAACTGCTCCGACACCAAACCCTTCTGCCCAAGACGATAAATTGGATAAGCTATGCAACATGTTTGAGAAATTCATGACGAACCAAGGAACATCCAACCAAGGGACCCCCAACATCCGAAAACCTGTGAAGACATGCCAACTTTGCATTGCAAATTCACATGCAACTGATGAATGCCCACAATTGTTCGAAGATGAAGAACTTAATGCCATTGGGCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803338.1
MAEESRDEEGTIVRTAPTPNPSAQDDKLDKLCNMFEKFMTNQGTSNQGTPNIRKPVKTCQLCIANSHATDECPQLFEDEELNAIGQQPGGNNEGQHKKSFEPYRQQYNNQGWRQHENLRYGNNNFLGPNQGQTSNPPQYSQQPQQARGSSLSELVHQMAQQPVKFQQETEKFIMETRGGMQNVNAQLSHLAQAVARLESKQGELPSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVVAKKNQEEPEVSEEVGMGSADEEELTQERETKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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