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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002024`

染色体: Chr03 坐标: 30351231-30352802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002024`
名称	SmilChr03G002024
描述	uncharacterized SmilChr03G002024
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	30351231 - 30352802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018641`
GeneID	`131018641`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018641`
原始查询	`LOC131018641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=39.1; qcov=0.132; evalue=3.98e-07; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=29.5; qcov=0.182; evalue=1.14e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018641

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803340.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057803340.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803340.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803340.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:30351235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B11,B53,C23,C74
`Chr3:30351274`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr3:30351274`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr3:30351365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr3:30351390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:30351409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr3:30351417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:30351495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:30351517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:30351533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:30351542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:30351552`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947357.1
ATGGCCGAGGAATCAAGGGATGAGGAAGGAACAATAGTCAGAACTGCTCCGACACCAAACCCTTCTGCCCAAGACGATAAATTGGATAAGCTATGCAACATGTTTGAGAAATTCATGACGAACCAAGGAACATCCAACCAAGGGACCCCCAACATCCGAAAACCTGTGAAGACATGCCAACTTTGCATGGCAAATTCACATGCAACTGATGAATGCCCACAATTGTTCGAAGATGAAGAACTTAATGCCATTGGGCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018641
ATGGCCGAGGAATCAAGGGATGAGGAAGGAACAATAGTCAGAACTGCTCCGACACCAAACCCTTCTGCCCAAGACGATAAATTGGATAAGCTATGCAACATGTTTGAGAAATTCATGACGAACCAAGGAACATCCAACCAAGGGACCCCCAACATCCGAAAACCTGTGAAGACATGCCAACTTTGCATGGCAAATTCACATGCAACTGATGAATGCCCACAATTGTTCGAAGATGAAGAACTTAATGCCATTGGGCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803340.1
MAEESRDEEGTIVRTAPTPNPSAQDDKLDKLCNMFEKFMTNQGTSNQGTPNIRKPVKTCQLCMANSHATDECPQLFEDEELNAIGQQPGGNNEGQHQKSFEPYRQQYNNQGWRQHENLRYGNNNFLGPNQGQTSNPPQYSQQPQQARGSSLSELVHQMAQQPVKFQQETEKFIMETRGGMQNVNAQLSHLAQAVARLESKQGELPSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVVGKKNQEEPEVSEEVGMGSADEEELTQERETKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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