当前解析结果
SmilChr03G002056| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002056 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002056 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002056 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 31291352 - 31294071 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018652 |
|---|---|
| GeneID | 131018652 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018652 |
| 原始查询 | LOC131018652 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00860- identity=32.4; qcov=0.402; evalue=2.77e-06; confidence=low |
| Rice | Os04g0191000- identity=37.2; qcov=0.467; evalue=2.8e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018652 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803350.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803350.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057803350.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803350.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803350.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:31291358 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B23,B37,B59,B90,C84 |
Chr3:31291391 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,B90 |
Chr3:31291392 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,C18 |
Chr3:31291416 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B68,C2,C85 |
Chr3:31291421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,C3 |
Chr3:31291448 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B131,B56,C42,C61,C82 |
Chr3:31291480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B29,C18,C62 |
Chr3:31291496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D5 |
Chr3:31291504 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,C72 |
Chr3:31291525 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,D4 |
Chr3:31291623 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B40,C44 |
Chr3:31291623 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B40,C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。