当前解析结果
SmilChr03G002067| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002067 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002067 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002067 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 31563498 - 31563962 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018654 |
|---|---|
| GeneID | 131018654 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018654 |
| 原始查询 | LOC131018654 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018654 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803353.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803353.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803353.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803353.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803353.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:31563511 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B128,B81,B97,C31,C49,C55 |
Chr3:31563536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B47,C2 |
Chr3:31563539 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D10 |
Chr3:31563547 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A13,B110,B112,B113,B83,C13,C14,C18,C2,C20,C25,C37,C45,C48,C5,C51,C59,C79 |
Chr3:31563589 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B140,C48,C58 |
Chr3:31563600 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A15,B112,B31,B40,B76,B77,B9,C21,C38,C74,C79 |
Chr3:31563615 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A13,B110,B113,B83,C13,C14,C18,C2,C20,C25,C37,C45,C48,C5,C51,C59,C79 |
Chr3:31563637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B71 |
Chr3:31563689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr3:31563696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B37,C16,C43 |
Chr3:31563707 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:31563711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 13 | A14,B125,B17,B38,B39,B48,B7,B95,C20,C28,C39,C72,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。