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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002083`

染色体: Chr03 坐标: 32047580-32052217 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002083`
名称	SmilChr03G002083
描述	uncharacterized SmilChr03G002083
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	32047580 - 32052217 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018659`
GeneID	`131018659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018659`
原始查询	`LOC131018659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=43.9; qcov=0.766; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803357.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803357.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803357.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803357.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:32048505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr3:32048506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr3:32048544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:32048548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B65,D6
`Chr3:32048563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:32048609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B135,B7,C60,D10
`Chr3:32048616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:32048756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:32048794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C78
`Chr3:32048820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:32048854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:32048962`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B63,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803357.1

1096 aa

548

1096

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 9-82 aa PF02992 Transposase_21 282-486 aa PF13960 DUF4218 679-791 aa PF13952 DUF4216 920-968 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803357.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	9	82	5.8e-21	75.2	Transposase-associated domain
`XP_057803357.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	282	486	8.3e-94	313.4	Transposase family tnp2
`XP_057803357.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	679	791	2.2e-49	166.8	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057803357.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	920	968	3.2e-11	44.3	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947374.1
ATATTTATATACTTTATGTGAGGAAATTTTATATCATTACATAAAAATAAAAGATGGGGTCATTTTTATAATTATGTTAAAGTTAAGTCCTCATACGAAAAAAGTAAAAACTAGAATTCATTCTCTGCAATCTTCATTCTCATCAGCCTGACTTCAAAAACAGAAAACAATATTATATCATATTTTCTATCTAAAATGAGAAGAGACCTACAATTGATCTGATTCATGGAAGAGTACCGATAATTTGCAGCTTCTTGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018659
ATGCTCAGGTACTATCTCATGGATAGAAGTTGGACCAATGATAAAAATAGATTTTCTAAGACTTATATTGAAGGAGTGGAATCATTTCTTGACTTCGCGAAAGAAAATGTTAATAGATCCGATGATTTGCTTCGAAGTCCGTGTCGTTGTTGTCTCAATACAAGATTCAAAACTTTTGAAGAAGTTAAGCGTCATCTGCACCTGAATGGTTTTTCTAATAGTTATACTAAATGGATATATCACGGTGATAAAGTTAGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803357.1
MLRYYLMDRSWTNDKNRFSKTYIEGVESFLDFAKENVNRSDDLLRSPCRCCLNTRFKTFEEVKRHLHLNGFSNSYTKWIYHGDKVSTFGDSESNEDDDNLIDNEANESNEDIYDMLCELGEREPECFTKLFENASIKLYHGGKVSLLSVVIKLMHIKVKNKWSNKSFDMLLLLLKDILPEGNTLPSSFYGAKKVLDEMELGYQEIEVCKHDCALFYKENENEEKCLVCSEPRWKFTKGKGGKTPHKILRHFPLKSRLQKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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