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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002154`

染色体: Chr03 坐标: 33500480-33501691 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002154`
名称	SmilChr03G002154
描述	uncharacterized SmilChr03G002154
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33500480 - 33501691 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018680`
GeneID	`131018680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018680`
原始查询	`LOC131018680`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=31.9; qcov=0.288; evalue=1.76e-17; confidence=weak
Rice	`Os09g0268800` - identity=27.3; qcov=0.273; evalue=3.21e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803376.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803376.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803376.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803376.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33500507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B110,B32,B73,D2
`Chr3:33500522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B58,B64
`Chr3:33500536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:33500565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B26,C1,D10
`Chr3:33500594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C70
`Chr3:33500596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A3,B1,B118,B123,B137,B138,B16,B24,B38,B39,B47,B55,B57,B98,C19,C2,C25,C33,C4,C5,C74,D4
`Chr3:33500598`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	200	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B104,B105,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B123,B126,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D8
`Chr3:33500602`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B108,B33,C85
`Chr3:33500602`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B108,B33,C85
`Chr3:33500611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B42,B43,B90,B92
`Chr3:33500655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:33500676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803376.1

403 aa

202

403

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 90-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803376.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	90	137	2.2e-07	31.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947393.1
ATGGAAGACAAAAAGGTTGCTAAGGGGAAGCTAAATCTTGATATATCCAATGGTAGTTTGCGTCTGAGGGAATGGGTTCCGAAATTTGATCCTTACAAAGAATGTTCCTCATTGGCTCAAGTTTGGGTGCGCATTTATTATTTGCCTATCGAACTATGGCATCCAGAAGTTATAGCGGCTGTTGGTCGTTACTTGGGAAATCCGATTCGCATTGATGGTGGTTCGGCGAATAGAGAGGTGGGACACTATGCTCGGGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018680
ATGGAAGACAAAAAGGTTGCTAAGGGGAAGCTAAATCTTGATATATCCAATGGTAGTTTGCGTCTGAGGGAATGGGTTCCGAAATTTGATCCTTACAAAGAATGTTCCTCATTGGCTCAAGTTTGGGTGCGCATTTATTATTTGCCTATCGAACTATGGCATCCAGAAGTTATAGCGGCTGTTGGTCGTTACTTGGGAAATCCGATTCGCATTGATGGTGGTTCGGCGAATAGAGAGGTGGGACACTATGCTCGGGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803376.1
MEDKKVAKGKLNLDISNGSLRLREWVPKFDPYKECSSLAQVWVRIYYLPIELWHPEVIAAVGRYLGNPIRIDGGSANREVGHYARVLIEIDLSVPLRESLMIDEDNSSIYIEFSYESLPEFCMHCKIVGHTSDKCRKLKQREDMKNKKTVGNTNKDEKVEGSKQEKQQLAVEHKWQQKQQNALTEQTSAETTNAVDTAKKRSEVSVNSEDNRALLQSAAMDSPGSMEQSDFSNKVNTSNSFMTLTDTEDNGQETGLDLLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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