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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002171`

染色体: Chr03 坐标: 33769698-33771496 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002171`
名称	SmilChr03G002171
描述	uncharacterized SmilChr03G002171
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33769698 - 33771496 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018685`
GeneID	`131018685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018685`
原始查询	`LOC131018685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=36.8; qcov=0.619; evalue=2.51e-60; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF08284 (RVP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803382.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803382.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803382.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803382.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33769713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C3
`Chr3:33769718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:33769761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A9,B10,B112,B26,B3,B47,B82,C22,C41,C56,C76
`Chr3:33769765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:33769766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B40,B49
`Chr3:33769844`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A19,A8,B103,B125,B13,B36,B53,B72,C17,C30,C35,C45,C5,C6,C7,C73,C75,D10
`Chr3:33769849`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A6,B101,B102,B134,B137,B16,B29,B41,B50,B60,B61,B68,B70,C15,C50,C61,C62,C75,D9
`Chr3:33769883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B57,B88,C19
`Chr3:33769886`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B137,B16,B32,B37,B64,B68,B84,C19,C55,C80,C84,D2,D8
`Chr3:33769910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:33769911`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A15,A16,A22,A9,B105,B112,B115,B120,B124,B131,B136,B17,B2,B20,B26,B3,B31,B34,B46,B47,B52,B56,B58,B62,B67,B69,B74,B79,B82,B83,B86,B88,B94,B96,B97,B99,C18,C2,C22,C23,C24,C29,C3,C34,C38,C40,C41,C44,C45,C46,C48,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C62,C63,C64,C67,C71,C76,C79,C80,C81,C86,D11
`Chr3:33769913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803382.1

527 aa

264

527

RVP_2

RVT_1

PF08284 RVP_2 179-246 aa PF00078 RVT_1 379-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803382.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	179	246	2.3e-14	54.1	Retroviral aspartyl protease
`XP_057803382.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	379	527	3.8e-32	112.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947399.1
ATGGATAAATATTTCCCCCTCTCATTTAGAGAAAAGAAGGAGACTGAGTTCTTTGAGTTGAAACAAGGGAACATGACTATAGAGGAGTATGAGAGAAAATTTAATGAGTTAGCTAGATTCACACCACACCTAGTTGATACAGAAGATAAGATGATAGCCAGGTTCAGGAAAGGATTGAGAACTGACATCAAAGGAATTATGGCTGCACATGTGATCGAGGATTTCAGTGATCTGGTTAAGCGAGCCGAAGAGGTGGTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018685
ATGGATAAATATTTCCCCCTCTCATTTAGAGAAAAGAAGGAGACTGAGTTCTTTGAGTTGAAACAAGGGAACATGACTATAGAGGAGTATGAGAGAAAATTTAATGAGTTAGCTAGATTCACACCACACCTAGTTGATACAGAAGATAAGATGATAGCCAGGTTCAGGAAAGGATTGAGAACTGACATCAAAGGAATTATGGCTGCACATGTGATCGAGGATTTCAGTGATCTGGTTAAGCGAGCCGAAGAGGTGGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803382.1
MDKYFPLSFREKKETEFFELKQGNMTIEEYERKFNELARFTPHLVDTEDKMIARFRKGLRTDIKGIMAAHVIEDFSDLVKRAEEVVTGLGSNIPAPKPTNQPIKRKWENHNQGGGNFQDKRPKFGGNTRHTVQNYPKTKKNVTDGKKNVGPEKKGNARFFALADQEAAEDDDIMTQNLALNISVPSGECIKTDRISRRISLNFRSRKLEADLYLIEMHDSDVILDMDWLSQNFATITCHEREIVFKVPGKKEFSFRGSKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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