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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002187`

染色体: Chr03 坐标: 34160780-34161922 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002187`
名称	SmilChr03G002187
描述	uncharacterized SmilChr03G002187
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34160780 - 34161922 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018691`
GeneID	`131018691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018691`
原始查询	`LOC131018691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=29.8; qcov=0.442; evalue=4.01e-21; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=24; qcov=0.537; evalue=6.66e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803387.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803387.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803387.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34160809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B33,B48,B6
`Chr3:34160811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:34160832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B78,C42,C6
`Chr3:34160869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:34160886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:34160888`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A16,C64
`Chr3:34160888`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A16,C64
`Chr3:34160894`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A16,C64
`Chr3:34160894`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A16,C64
`Chr3:34160903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B88,C64
`Chr3:34160914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:34160937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803387.1

380 aa

190

380

DUF4283

PF14111 DUF4283 23-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803387.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	23	109	8.7e-07	29.3	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947404.1
ATGCGACCTTGCAGCTGTGATACTATTGGTATTCTTAAAGTTCCTAAGGATCTTCAACTTGCTCAAACGTCCAAGTTCCAATTCGCTTTGATTGGCCGATTCATGATGAACAAGGGGGCAAAACCTAAGACCACACGTGAGTTGAAAACGGAGCTGCAATCGATTTGGTCTTTGACATCACCTTGGCATTTAATGCCAATGGGAAAAGGTTACTTTACGTTGAAGTTTTACAACAAAGAGGATAAAGCGACTGCAAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018691
ATGCGACCTTGCAGCTGTGATACTATTGGTATTCTTAAAGTTCCTAAGGATCTTCAACTTGCTCAAACGTCCAAGTTCCAATTCGCTTTGATTGGCCGATTCATGATGAACAAGGGGGCAAAACCTAAGACCACACGTGAGTTGAAAACGGAGCTGCAATCGATTTGGTCTTTGACATCACCTTGGCATTTAATGCCAATGGGAAAAGGTTACTTTACGTTGAAGTTTTACAACAAAGAGGATAAAGCGACTGCAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803387.1
MRPCSCDTIGILKVPKDLQLAQTSKFQFALIGRFMMNKGAKPKTTRELKTELQSIWSLTSPWHLMPMGKGYFTLKFYNKEDKATAKSHIVWELSSGSLRLRDWVRYFNPYKESSSLAKVWVRIYYLPVELWHPEVLSSIGRWLGQPLKIDGNSIDDEAAHFARLLVEIDLAQILPEYMTIYGGDYKFHIEFNYEYLPPFCTKYRMTGHAVDKCRRGKKSSKELVEAVKQKGPHWQEVTKSKEQHDKRLNAMEGVVSIAEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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