当前解析结果
SmilChr03G002202| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002202 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002202 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002202 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 34657096 - 34658631 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018697 |
|---|---|
| GeneID | 131018697 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018697 |
| 原始查询 | LOC131018697 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018697 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803394.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057803394.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057803394.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057803394.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057803394.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:34657100 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr3:34657202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C60,D2,D4,D7 |
Chr3:34657231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,C52,C74 |
Chr3:34657248 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B132,B15,B43,B86 |
Chr3:34657285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B57,C60,D4,D7 |
Chr3:34657290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C15,C21,D1,D10 |
Chr3:34657319 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B10,B126 |
Chr3:34657328 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr3:34657375 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
Chr3:34657384 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B104,B62,B8,B80,C42,C6,C76,C77 |
Chr3:34657394 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B138,B33,B97 |
Chr3:34657396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B104,B85,B99,C64,C66,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。