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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002225`

染色体: Chr03 坐标: 35068704-35071312 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002225`
名称	SmilChr03G002225
描述	uncharacterized SmilChr03G002225
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35068704 - 35071312 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018705`
GeneID	`131018705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018705`
原始查询	`LOC131018705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.7; qcov=0.607; evalue=7.46e-62; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.9; qcov=0.619; evalue=1.08e-66; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803400.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803400.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803400.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803400.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35068855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:35068867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr3:35068870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C17,C40
`Chr3:35068887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C87
`Chr3:35068972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,C28,C87,D3
`Chr3:35068993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,D8
`Chr3:35069128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C77
`Chr3:35069136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr3:35069165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A20,A4,A8,B137,B67,C39,C40,C42,C49,C63,C87,D5
`Chr3:35069189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:35069203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C30
`Chr3:35069311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B113,B129,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803400.1

843 aa

422

843

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 456-603 aa PF10551 MULE 457-550 aa PF04434 SWIM 702-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803400.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	456	603	4.4e-13	49.6	Transposase, Mutator family
`XP_057803400.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	457	550	2.3e-20	73.5	MULE transposase domain
`XP_057803400.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	702	732	1.1e-06	28.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947417.1
ATGACGGAGTGGAAGAATATTATTGTAAATTATGGAGGATATTGGAATGATATTCTTTACAGTGGTGGGAGTGCAACATTTTGTTACATTCGAGCCGATAATATATGCATTTTGGAATTGAGACAAAGTATTGACTATTATTTGGTTGCCAACTCTTTGAATCCAAGCTACGATCTGTATTATTTATCAAGAACTCGAAGTGGTAGGCTGATCCGGTCTCTGTTAAGCAACAATGAACAACTTTTCCGATTATGCAGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018705
ATGACGGAGTGGAAGAATATTATTGTAAATTATGGAGGATATTGGAATGATATTCTTTACAGTGGTGGGAGTGCAACATTTTGTTACATTCGAGCCGATAATATATGCATTTTGGAATTGAGACAAAGTATTGACTATTATTTGGTTGCCAACTCTTTGAATCCAAGCTACGATCTGTATTATTTATCAAGAACTCGAAGTGGTAGGCTGATCCGGTCTCTGTTAAGCAACAATGAACAACTTTTCCGATTATGCAGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803400.1
MTEWKNIIVNYGGYWNDILYSGGSATFCYIRADNICILELRQSIDYYLVANSLNPSYDLYYLSRTRSGRLIRSLLSNNEQLFRLCSTEVEPQVYVTLKESTFPPPQQEVYRPSMDIPSSSTSFDHSIVDQMRAFDWFSDSTPNSTMNHHTMRSIGDDDVDDDEYVPSTDSDGDDEEEEEADERESARVDYGTFAEHIAWIRREGGIGELMAMIMQTNPRGLSEDLGPEASQELRNWLVPVIPEDFTENLFAGRLADIPNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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