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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002253`

染色体: Chr03 坐标: 35452741-35454186 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002253`
名称	SmilChr03G002253
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35452741 - 35454186 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018709`
GeneID	`131018709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018709`
原始查询	`LOC131018709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
产物	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
Arabidopsis	`AT4G08250` (AT4G08250) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826375] identity=27; qcov=0.931; evalue=1.14e-19; confidence=low
Rice	`Os03g0263300` (NSP2) - identity=24.7; qcov=1.02; evalue=3.53e-14; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803404.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803404.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803404.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803404.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35452917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C58,D11,D4
`Chr3:35452932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35453241`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr3:35453241`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr3:35453260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:35453418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B2,B75,C51,D1
`Chr3:35453480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B117
`Chr3:35453561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:35453727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:35453972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:35453981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C42,C6
`Chr3:35453993`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B125,B51,B59,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803404.1

481 aa

240

481

GRAS

PF03514 GRAS 120-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803404.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	120	475	2e-39	136.3	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947421.1
ATGGACATAGAAGGAGTGTTTTTCTCTTCATTCGCCTTGTCCGAAGATTCCTCTATGGTATCTTCAGACTCGTATTTCCCAGATACGTTTCCCGACAACCTTTTTAATCATGATAGTTTACTGATTACTTCGCATGACGATGGTCTTGTGAAGATCTTGAGAAGCGACATTGATGACATATGTGACTGGCTTTACGCCGGTCATAGTGAAGATGGGACTTGTTCGTCTGCAGTTTGGGCTGCAGACGAATGGAGTCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018709
ATGGACATAGAAGGAGTGTTTTTCTCTTCATTCGCCTTGTCCGAAGATTCCTCTATGGTATCTTCAGACTCGTATTTCCCAGATACGTTTCCCGACAACCTTTTTAATCATGATAGTTTACTGATTACTTCGCATGACGATGGTCTTGTGAAGATCTTGAGAAGCGACATTGATGACATATGTGACTGGCTTTACGCCGGTCATAGTGAAGATGGGACTTGTTCGTCTGCAGTTTGGGCTGCAGACGAATGGAGTCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803404.1
MDIEGVFFSSFALSEDSSMVSSDSYFPDTFPDNLFNHDSLLITSHDDGLVKILRSDIDDICDWLYAGHSEDGTCSSAVWAADEWSPSPSLESNQIAHVLTEVAIDLPRKDAKLENELTLTHLLRAFGEAMNDGNNGSLAKVIVESINEKSSPQGNLIERVAYNMFKSKDGEYLRQESVKNFATALNVLYRSLICGRFAHNAANAAILESIPEDVTVLHIVDFEIGEGIQWPALMEALSRKQKPVVRLTAIKREGEDAFEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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