当前解析结果
SmilChr03G002379| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002379 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002379 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 37550049 - 37551242 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018746 |
|---|---|
| GeneID | 131018746 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018746 |
| 原始查询 | LOC131018746 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018746 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803435.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803435.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803435.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803435.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803435.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:37550052 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B122,B47 |
Chr3:37550056 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr3:37550068 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C31,C55 |
Chr3:37550075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr3:37550106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | C18,C65,C8,C81,D10,D6,D7 |
Chr3:37550107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr3:37550112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr3:37550114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr3:37550115 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 93 | A10,A13,A21,A23,A25,A6,A7,A9,B100,B107,B110,B112,B114,B118,B119,B121,B125,B126,B128,B129,B13,B132,B136,B15,B19,B20,B24,B3,B31,B34,B36,B42,B43,B46,B5,B53,B56,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B71,B72,B76,B8,B80,B87,B91,B93,B94,B95,B97,C10,C13,C14,C15,C17,C19,C20,C21,C25,C26,C3,C32,C36,C4,C42,C43,C45,C47,C5,C53,C54,C56,C57,C58,C61,C65,C68,C7,C71,C77,C79,C8,C83,C85,D10,D11,D8,D9 |
Chr3:37550116 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr3:37550136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,C8,D7 |
Chr3:37550137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C26,C46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。