当前解析结果
SmilChr03G002384| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002384 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002384 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002384 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 37652021 - 37652524 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018751 |
|---|---|
| GeneID | 131018751 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018751 |
| 原始查询 | LOC131018751 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018751 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803439.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057803439.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803439.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803439.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803439.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:37652024 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B97,C78 |
Chr3:37652031 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 53 | A15,A2,A9,B105,B108,B11,B113,B117,B125,B130,B131,B136,B137,B19,B2,B21,B27,B28,B31,B35,B45,B48,B59,B68,B69,B70,B71,B80,B87,B9,B93,B94,C14,C21,C26,C27,C28,C29,C34,C36,C42,C45,C47,C48,C62,C64,C7,C82,C84,D1,D4,D5,D8 |
Chr3:37652076 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B120,B44 |
Chr3:37652076 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B120,B44 |
Chr3:37652079 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B120,B44 |
Chr3:37652079 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B120,B44 |
Chr3:37652082 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr3:37652120 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr3:37652179 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,D6 |
Chr3:37652191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,B52,C54 |
Chr3:37652193 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr3:37652258 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。