当前解析结果
SmilChr01G000516| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000516 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000516 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000516 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 10611243 - 10612193 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018756 |
|---|---|
| GeneID | 131018756 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018756 |
| 原始查询 | LOC131018756 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0484800- identity=28.2; qcov=0.661; evalue=4.54e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018756 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803472.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057803472.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803472.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803472.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803472.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:10611288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr1:10611297 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,B94 |
Chr1:10611325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B126,B75,B9,C37,C44 |
Chr1:10611343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B119,B3,C24,C35,D4,D9 |
Chr1:10611348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr1:10611415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr1:10611437 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A21,A4,B108,B111,B120,B127,B131,B140,B22,B4,B51,B56,B59,B85,B86,B96,C23,C26,C36,C62,C76 |
Chr1:10611445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B19,B27,C56,C60 |
Chr1:10611497 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B103,B114,B31,B44,B58,B6,C74,D3 |
Chr1:10611520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B68,C85 |
Chr1:10611575 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B54,C1 |
Chr1:10611663 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B100,B109,B53,B61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。