当前解析结果
SmilChr03G002400| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002400 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002400 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002400 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 38065515 - 38065859 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018760 |
|---|---|
| GeneID | 131018760 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018760 |
| 原始查询 | LOC131018760 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018760 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803447.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803447.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803447.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803447.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803447.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:38065518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr3:38065525 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A9,B112,B77,B82,C65 |
Chr3:38065525 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A9,B112,B77,B82,C65 |
Chr3:38065561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr3:38065571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr3:38065574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr3:38065627 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B13,B53,C27,C73 |
Chr3:38065664 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 23 | A14,A16,A18,A23,A25,A5,B101,B123,B130,B136,B138,B15,B26,B32,B40,B46,B63,B73,B85,C16,C26,C37,C84 |
Chr3:38065671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,A6,A8,B29 |
Chr3:38065673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr3:38065679 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A24,B28,B46,B75,C83,D3 |
Chr3:38065751 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。