当前解析结果
SmilChr03G002445| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002445 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002445 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002445 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 38842091 - 38842719 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018779 |
|---|---|
| GeneID | 131018779 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018779 |
| 原始查询 | LOC131018779 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018779 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057803467.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057803467.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057803467.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803467.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803467.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:38842235 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B32,C23,C55,D8 |
Chr3:38842244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr3:38842245 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,B9 |
Chr3:38842288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B63,B83 |
Chr3:38842328 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A18,B107,B130,B7,B93,C19,C78,C83 |
Chr3:38842461 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B95,C20,C32,C68 |
Chr3:38842461 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B95,C20,C32,C68 |
Chr3:38842469 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B95,C20,D11,D6 |
Chr3:38842479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr3:38842495 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 121 | A10,A11,A14,A16,A18,A2,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A9,B1,B100,B102,B103,B107,B108,B11,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B13,B130,B131,B136,B138,B140,B15,B16,B17,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B28,B32,B37,B40,B46,B47,B49,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B63,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B80,B83,B84,B85,B86,B93,B96,B99,C11,C13,C14,C16,C18,C21,C24,C26,C28,C29,C33,C36,C38,C4,C40,C41,C44,C47,C48,C49,C52,C57,C58,C60,C62,C65,C69,C71,C72,C73,C74,C78,C8,C82,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4 |
Chr3:38842503 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B71,B95,C46,D6 |
Chr3:38842506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B71,B95,C46,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。