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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002477`

染色体: Chr03 坐标: 39289145-39290449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002477`
名称	SmilChr03G002477
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39289145 - 39290449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018784`
GeneID	`131018784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018784`
原始查询	`LOC131018784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
产物	protein PSK SIMULATOR 1-like
Arabidopsis	`AT5G51670` (AT5G51670) - identity=32.2; qcov=1; evalue=4.86e-58; confidence=low
Rice	`Os05g0457600` (OJ1362_D02.2) - identity=38.1; qcov=1.12; evalue=3.81e-72; confidence=medium
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803475.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803475.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057803475.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803475.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803475.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39289270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:39289333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C32,C68
`Chr3:39289355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B74,B91,C47,C78
`Chr3:39289375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B13,B22,C13
`Chr3:39289668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B73,B74,C47,C78
`Chr3:39290116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B47,C33,C72,C77
`Chr3:39290188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C9
`Chr3:39290189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B99,C19,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803475.1

434 aa

217

434

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 22-77 aa PF05003 DUF668 284-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803475.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	22	77	8.8e-24	84.0	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057803475.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	284	373	2.7e-25	89.3	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947492.1
ATGGTCGGGTTCAAGCACATCGGGTGGCTGCCGGAGCCCAAGAAAGAAGGGAACAATCTCGGCATCCTCTCATTCGAGACGGCCAAGACCATGTCGAGATTGATCTCTCTCTACAAGTCTGTCTCCGACGAAGAGATTTCCCGGCTGAGAAACGACGTAATCCGCTCGAAGGGAGTAGCATTTTTGAACTCCGACGATGAGGGTTTCCTCCTTGGGTTGGCCTGCGCAGAGCGCCTCGAGGATCTCGACCGCGCCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018784
ATGGTCGGGTTCAAGCACATCGGGTGGCTGCCGGAGCCCAAGAAAGAAGGGAACAATCTCGGCATCCTCTCATTCGAGACGGCCAAGACCATGTCGAGATTGATCTCTCTCTACAAGTCTGTCTCCGACGAAGAGATTTCCCGGCTGAGAAACGACGTAATCCGCTCGAAGGGAGTAGCATTTTTGAACTCCGACGATGAGGGTTTCCTCCTTGGGTTGGCCTGCGCAGAGCGCCTCGAGGATCTCGACCGCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803475.1
MVGFKHIGWLPEPKKEGNNLGILSFETAKTMSRLISLYKSVSDEEISRLRNDVIRSKGVAFLNSDDEGFLLGLACAERLEDLDRAAAAVARLGKKCSDFGLERFDLVYKELKEGVVSSGKLRYGSSAAERKIRKIERLVAATSGLHGAVESLAEMEVSERKMKQWKSRDSDLQKANYDNLIQKLEIQRREIRNFKEISLWNKSFDKCVDLMARVVLVVHRRICGLFGPRKRIPMKEKVFPHSGPLLTASKPVMVRFYSRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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