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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002482`

染色体: Chr03 坐标: 39408489-39409055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002482`
名称	SmilChr03G002482
描述	uncharacterized SmilChr03G002482
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39408489 - 39409055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018785`
GeneID	`131018785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018785`
原始查询	`LOC131018785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=32; qcov=0.602; evalue=2.35e-06; confidence=low
Rice	`Os03g0158600` - identity=36; qcov=0.536; evalue=1.17e-06; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803476.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803476.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803476.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803476.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39408494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:39408507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr3:39408507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:39408526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C23,C55,D8
`Chr3:39408531`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A14,A16,A18,A23,A25,A5,B10,B103,B121,B130,B136,B138,B15,B20,B26,B32,B35,B40,B47,B6,B63,B64,B68,B73,B84,C11,C16,C22,C24,C33,C69,C72,C73,C84,D2
`Chr3:39408537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C44
`Chr3:39408571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:39408581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:39408584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:39408586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A14,A16,A18,A23,A4,A5,B10,B103,B113,B12,B121,B124,B130,B136,B138,B15,B20,B26,B32,B35,B37,B40,B47,B49,B6,B63,B64,B68,B73,B84,B97,B99,C11,C16,C22,C23,C24,C33,C55,C64,C66,C69,C72,C73,C84,D11,D2,D8
`Chr3:39408601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B113,B138,B37
`Chr3:39408606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803476.1

166 aa

166

RVT_3

PF13456 RVT_3 37-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803476.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	37	116	2.3e-10	41.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947493.1
ATGGACTACTCTATGATTCGAGCTATTGTGGTTTCTTCTCGGGTTGCTGCTTCGCCAAAAGTTATTAACGTTTATTGGTGGCCGCCAATTGACGACTGGATTAAAGTTAATACAGACGGTTCGGCCCTTGGGGCCCCGGGCAAGATTACCGCTGGCGCGTTCTTTCGCGACAAGTGGAGTTGGGTTAGAGGGTGCTTTCACATTAAAGGTGGTATTGGCTTTGCCTTCAAAGCTAAATTACTTGCCATTATCACGGCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018785
ATGGACTACTCTATGATTCGAGCTATTGTGGTTTCTTCTCGGGTTGCTGCTTCGCCAAAAGTTATTAACGTTTATTGGTGGCCGCCAATTGACGACTGGATTAAAGTTAATACAGACGGTTCGGCCCTTGGGGCCCCGGGCAAGATTACCGCTGGCGCGTTCTTTCGCGACAAGTGGAGTTGGGTTAGAGGGTGCTTTCACATTAAAGGTGGTATTGGCTTTGCCTTCAAAGCTAAATTACTTGCCATTATCACGGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803476.1
MDYSMIRAIVVSSRVAASPKVINVYWWPPIDDWIKVNTDGSALGAPGKITAGAFFRDKWSWVRGCFHIKGGIGFAFKAKLLAIITAIGIAHSRGWTKLWVEADSSYVVSLLETHSKQISHIYREGNQAADLMANPQRHEGWWPYAIDEIKHAVAMDMSSHSYICYK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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