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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002483`

染色体: Chr03 坐标: 39466613-39467423 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002483`
名称	SmilChr03G002483
描述	maturase K-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39466613 - 39467423 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018787`
GeneID	`131018787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018787`
原始查询	`LOC131018787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	maturase K-like
产物	maturase K-like
Arabidopsis	`ATCG00040` - identity=55.5; qcov=0.748; evalue=1.31e-59; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0006397 (mRNA processing); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF01824 (MatK_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803477.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803477.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803477.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803477.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39466619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B38,B84,C54
`Chr3:39466632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B140,B90,C25
`Chr3:39466644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B15,B99,D4
`Chr3:39466645`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,A24,B53,C42,C82
`Chr3:39466645`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A18,A24,B53,C42,C82
`Chr3:39466646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A11,B73,C39,C58,C69
`Chr3:39466646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B73,C39,C58,C69
`Chr3:39466647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A5
`Chr3:39466647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:39466652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:39466658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B53,C82
`Chr3:39466659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A5,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803477.1

270 aa

135

270

MatK_N

PF01824 MatK_N 20-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803477.1`	Pfam	`PF01824`	MatK_N	Domain	20	194	5e-78	263.8	MatK/TrnK N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947494.1
ATGTATCATTTGATAACCCCCGAATCTTCTACCTTTAATTCAAATCGAATTCAAATGGAGAAAATCCAAAGATATTTACAGCTAAAGAGATCTCAACAACACGACTTCCTATATCCACTTATATTTCAGGAGTATATTTATGTGTTTGCTCATAATCGTGCTTTGAATAGATCTATTTTGTCGGAAAATCCAGGTTATGACAATAAATCCAGTTTACGGATTGTGAAACGGTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018787
ATGTATCATTTGATAACCCCCGAATCTTCTACCTTTAATTCAAATCGAATTCAAATGGAGAAAATCCAAAGATATTTACAGCTAAAGAGATCTCAACAACACGACTTCCTATATCCACTTATATTTCAGGAGTATATTTATGTGTTTGCTCATAATCGTGCTTTGAATAGATCTATTTTGTCGGAAAATCCAGGTTATGACAATAAATCCAGTTTACGGATTGTGAAACGGTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803477.1
MYHLITPESSTFNSNRXIQMEKIQRYLQLKRSQQHDFLYPLIFQEYIYVFAHNRALNRSILSENPGYDNKSSLRIVKRLITRMYQQNHLIISSNDSNKNPFLARNTNLYSQILSEGFAFIVEIPFFLQLRSCLEGKTNKKVKSHNLQSIHSIFPFLEDNFSHLNFVLDILIPRSVHVEILIQTLRHWVKDVSSLLRRRRWSQNSPNNPESAGRLPMYPPASYPGNAGPGETRRTPGAGPGPPERNHGSGHPCRSSSSHAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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