当前解析结果
SmilChr03G002484| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002484 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002484 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002484 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 39487231 - 39488946 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018788 |
|---|---|
| GeneID | 131018788 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018788 |
| 原始查询 | LOC131018788 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018788 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803479.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057803479.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057803479.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057803479.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803479.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:39487242 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,A5,B64 |
Chr3:39487275 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,B64 |
Chr3:39487287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,B95 |
Chr3:39487290 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr3:39487303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr3:39487321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B50,C69 |
Chr3:39487356 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr3:39487362 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A2,B101,B104,B106,B11,B12,B55,B78,B82,C56,C60 |
Chr3:39487370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B15,C2 |
Chr3:39487373 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B51,B78 |
Chr3:39487384 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr3:39487393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C25,C4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。