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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002487`

染色体: Chr03 坐标: 39548124-39549504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002487`
名称	SmilChr03G002487
描述	uncharacterized SmilChr03G002487
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39548124 - 39549504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018789`
GeneID	`131018789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018789`
原始查询	`LOC131018789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=58.2; qcov=0.434; evalue=2.6e-69; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=48.4; qcov=0.628; evalue=7.14e-84; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803480.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057803480.1`
3	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057803480.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803480.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39548317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:39548334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:39548417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:39548429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:39548481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B3,C83
`Chr3:39548879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:39548942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C20,C53,C66,D10,D8
`Chr3:39548960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B73
`Chr3:39548972`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A3,A4,B100,B48,B61,C14,C22,C41,C56,C65
`Chr3:39548989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C29
`Chr3:39548990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C63,D3
`Chr3:39549011`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A4,B122,B26,B61,C40,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803480.1

435 aa

218

435

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 71-161 aa PF01609 DDE_Tnp_1 191-337 aa PF13359 DDE_Tnp_4 197-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803480.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	71	161	7.7e-23	80.9	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057803480.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	191	337	3.7e-11	43.9	Transposase DDE domain
`XP_057803480.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	197	358	2.1e-25	89.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947497.1
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAATCAAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTATGATCTTGTTAGGCAACTGATGGAAGCTGCTAAGGTAGTTATCACTCTATTGGAAAATATTATGACGCTACATTCGACTGCTGACAACGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTTCGTTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018789
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAATCAAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTATGATCTTGTTAGGCAACTGATGGAAGCTGCTAAGGTAGTTATCACTCTATTGGAAAATATTATGACGCTACATTCGACTGCTGACAACGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTTCGTTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803480.1
MNYEDKINIAIEEDIDEELEDEIKTEMEIELYDLVRQLMEAAKVVITLLENIMTLHSTADNALMRRPKTREGFRFITRMMDGDPSQFQQLYRMYPDVFIKLCQIIREKAHVDDTRYTTVEEMLATFLIIVGHNDRYCNVRERFGRSHFATSQNFNKILRALNTIAPDMMVKPTGAIPAKIRESTRFYPYFKDCIGAIDGTHIPATIIGKDVSCYRNRHGVNSQNVLAACNFDLQFIYVLSGWEGSAHDSKILSDALSRPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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