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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002492`

染色体: Chr03 坐标: 39676587-39678797 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002492`
名称	SmilChr03G002492
描述	uncharacterized SmilChr03G002492
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39676587 - 39678797 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018790`
GeneID	`131018790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018790`
原始查询	`LOC131018790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29; qcov=0.562; evalue=2.73e-40; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=29.4; qcov=0.891; evalue=3.29e-87; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803482.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803482.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803482.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803482.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803482.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39676610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:39676649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A11,A6,B103,B110,B114,B120,B124,B133,B137,B15,B19,B2,B20,B23,B24,B39,B47,B49,B50,B52,B56,B58,B75,B79,B80,B85,B89,B96,C1,C11,C28,C34,C36,C48,C49,C63,C72,C76,C82,D1,D4,D5
`Chr3:39676651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:39676658`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr3:39676658`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr3:39676696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B73,C75,D8
`Chr3:39676697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B52,B82
`Chr3:39676712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C64
`Chr3:39676725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B70,C54,C58
`Chr3:39676738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:39676739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B98,C32,C87
`Chr3:39676740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803482.1

717 aa

358

717

RVT_1

PF00078 RVT_1 482-708 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803482.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	482	708	1.1e-29	104.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947499.1
ATGAATGTTATTGCTTGGAACGTCCGGGGTCTGACGGACGAGTCTAAGCGCCTCCTTTGGGAGCATTGTCGTACTTTCTCTCCTATTGTTTTTGGTATTATTAAGCCGAAGTCGAATCTCAGAAATTCTAACCACAATTATTGGTCTTCTCTTAATTTGATCCCTGCTTTTCAGAATGAGCGGCAGGACAGGTGTTCGAACATTTGGGTTTTACATCATCCTGATGTGGCGTTCAGATTGGTTTTTTCTTCGGAGCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018790
ATGAATGTTATTGCTTGGAACGTCCGGGGTCTGACGGACGAGTCTAAGCGCCTCCTTTGGGAGCATTGTCGTACTTTCTCTCCTATTGTTTTTGGTATTATTAAGCCGAAGTCGAATCTCAGAAATTCTAACCACAATTATTGGTCTTCTCTTAATTTGATCCCTGCTTTTCAGAATGAGCGGCAGGACAGGTGTTCGAACATTTGGGTTTTACATCATCCTGATGTGGCGTTCAGATTGGTTTTTTCTTCGGAGCAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803482.1
MNVIAWNVRGLTDESKRLLWEHCRTFSPIVFGIIKPKSNLRNSNHNYWSSLNLIPAFQNERQDRCSNIWVLHHPDVAFRLVFSSEQTVIADCHWNSFDFRVAIVHGASTHTERRSLWADLINFTADSMVILGDFNAVKGAHERISSCMPSQTSCREFCDFIDDTGFIESATSGLRFTWSGRCFIPQHVESFLDRALYSELFFSLWHSVHTLNLARLTSDHSPIVFQCSLPPQTRHRFFRFLNMWAMHPNFHALVEDSWRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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