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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002500`

染色体: Chr03 坐标: 39831050-39831934 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002500`
名称	SmilChr03G002500
描述	uncharacterized SmilChr03G002500
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39831050 - 39831934 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018792`
GeneID	`131018792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018792`
原始查询	`LOC131018792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.5; qcov=0.929; evalue=3.78e-38; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.5; qcov=1.04; evalue=8.31e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803484.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803484.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803484.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803484.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39831054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:39831093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B22
`Chr3:39831097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C19,C34,C48,C70
`Chr3:39831100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C48,C72
`Chr3:39831107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,C19,C34,C48,C70
`Chr3:39831111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:39831168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B9
`Chr3:39831170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:39831176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:39831191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A11,A13,A16,A21,B103,B11,B117,B118,B13,B139,B22,B27,B34,B35,B36,B49,B58,B61,B68,B69,B76,B80,B81,B86,B95,B97,B98,C13,C14,C20,C31,C32,C36,C37,C38,C39,C42,C48,C53,C58,C6,C68,C71,C72,C81,D1
`Chr3:39831221`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:39831221`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803484.1

268 aa

134

268

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 111-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803484.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	4.6e-19	68.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803484.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	111	268	6.8e-51	173.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947501.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGTGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTATTTCGCCGTCGATTTCGTATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018792
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGTGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTATTTCGCCGTCGATTTCGTATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803484.1
MTVASSYRFDPPPPRPRKKRTVVRRDREGGAECLHRDYFSVEPVYGPQLFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYETAVDCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTIADGWKNCPVAWHDAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTRGYYLTDDIYPDWPVFVKSFQFPNDEKKRRFKVMQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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