当前解析结果
SmilChr03G002568| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002568 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002568 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002568 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 40871282 - 40871989 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018808 |
|---|---|
| GeneID | 131018808 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018808 |
| 原始查询 | LOC131018808 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018808 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803499.1 |
| 2 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.80000 | XP_057803499.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057803499.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.60000 | XP_057803499.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.40000 | XP_057803499.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:40871313 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B137,B55,C2 |
Chr3:40871341 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr3:40871363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr3:40871386 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | B103,B128,B15,B18,B19,B21,B50,B53,B60,B8,B85,B91,B93,C28,C31,C49,C57,C74,C82,D10,D4 |
Chr3:40871416 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B61,B82,C72 |
Chr3:40871432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B120,B29,B32,C53 |
Chr3:40871449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B47,B61,B71,C38,C45,C6,D9 |
Chr3:40871453 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr3:40871545 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 49 | A15,A22,A23,A7,B100,B110,B112,B122,B123,B125,B126,B129,B134,B14,B21,B29,B30,B4,B44,B47,B49,B54,B6,B67,B69,B70,B73,B78,B90,B92,B94,B99,C10,C18,C19,C26,C35,C36,C45,C50,C6,C63,C64,C66,C67,C83,D11,D3,D9 |
Chr3:40871657 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B136 |
Chr3:40871657 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr3:40871692 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B137,B55,C2,C22 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。