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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002743`

染色体: Chr03 坐标: 43591080-43592390 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002743`
名称	SmilChr03G002743
描述	uncharacterized SmilChr03G002743
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43591080 - 43592390 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018846`
GeneID	`131018846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018846`
原始查询	`LOC131018846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.8; qcov=1.09; evalue=1.4e-24; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.6; qcov=1.16; evalue=1.18e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803528.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803528.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803528.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803528.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803528.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43591083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr3:43591108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B14,C35
`Chr3:43591131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B73,C84
`Chr3:43591137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C40
`Chr3:43591141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B88,C52,C63,C69
`Chr3:43591147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,C21,C30,C60
`Chr3:43591169`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A18,A3,A4,B110,B118,B119,B32,B33,B34,B4,B62,B97,C2,C40,C5,C55,C6,C75,C83
`Chr3:43591173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B46,C7,C84
`Chr3:43591199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B132,B7,B84,C74
`Chr3:43591201`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B102,B132,B21,B3,B37,B43,B55,B60,B82,C16,C24,C39,C4,D10
`Chr3:43591203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,C40,C76,C84
`Chr3:43591204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C43,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803528.1

361 aa

180

361

MULE

PF10551 MULE 32-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803528.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	32	82	4.2e-08	34.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947545.1
ATGGATTTGGAAGTAGACGAAAACAACCGGTTCAAACATCTGTTTCTTGCTCTTGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTTCTTTTCGCTTCGACCAGTGATTGTGGTCGACGGCACACACTTGAAGGGGAAGAACAATGGTATTTTGTTCGTCGCCGTGACAAAAGACGCAAACGAGCAAGTTTTTTCGTTGGCATTTGGTGTCGGGCCGATCGAGAATGATGAGTCATGGAAGTGGTTCCTCTCAAATAACAAAATTAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018846
ATGGATTTGGAAGTAGACGAAAACAACCGGTTCAAACATCTGTTTCTTGCTCTTGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTTCTTTTCGCTTCGACCAGTGATTGTGGTCGACGGCACACACTTGAAGGGGAAGAACAATGGTATTTTGTTCGTCGCCGTGACAAAAGACGCAAACGAGCAAGTTTTTTCGTTGGCATTTGGTGTCGGGCCGATCGAGAATGATGAGTCATGGAAGTGGTTCCTCTCAAATAACAAAATTAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803528.1
MDLEVDENNRFKHLFLALAASISPFFFSLRPVIVVDGTHLKGKNNGILFVAVTKDANEQVFSLAFGVGPIENDESWKWFLSNNKIKGYGQAVVELFRQAAYAYEDSEFSRAMSAMAQLKPAAYEKLMRVGLEKWARSQSPVTRYSFLTSNVAEALNARLLWARRLPICSMLEAIRMVLEQWFNDILASAEESDDLLTPEATQKISAEISKSRRYTAKRTSERKYRVRAGDRRYMVDLQAKSCECNEFDLDGMPEAKEPVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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