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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002784`

染色体: Chr03 坐标: 44304416-44305113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002784`
名称	SmilChr03G002784
描述	uncharacterized SmilChr03G002784
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44304416 - 44305113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018856`
GeneID	`131018856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018856`
原始查询	`LOC131018856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=32.1; qcov=1; evalue=2.76e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=33; qcov=1.21; evalue=1.8e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057803538.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803538.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803538.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803538.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44304439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:44304464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B69
`Chr3:44304504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:44304554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:44304561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B41,B97,C10,C74
`Chr3:44304595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A20,B21,B37,D8
`Chr3:44304601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B83,C46,C49,C70
`Chr3:44304610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B115,B78,B8,C77
`Chr3:44304622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A20,B21,B53,D8
`Chr3:44304627`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A11,A20,B21,B53,D8
`Chr3:44304627`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A11,A20,B21,B53,D8
`Chr3:44304634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B28,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803538.1

193 aa

193

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 119-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803538.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	119	192	7.3e-18	65.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947555.1
ATGCAGAAGGAGTTGTTTTTGCGCATTGCTGATGGTGAATACTTACTTCCGCATGAAACAAGATGCTACAGGCCAGACTCGCTCACGTCGTTGCAGAAATGCACGATGGTTCTCCGAAAATTAGCCACCGGTATTTCTGTGGATACTTTTGACGAGTATCTGAAGATTGCGGACACTACGGGGCGGCTATGCCTCAAGAAGTTTTGCAAAGCTTTCATCAAGGCATACAATGCCGAGTATCTTCGGCCTCCTACACTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018856
ATGCAGAAGGAGTTGTTTTTGCGCATTGCTGATGGTGAATACTTACTTCCGCATGAAACAAGATGCTACAGGCCAGACTCGCTCACGTCGTTGCAGAAATGCACGATGGTTCTCCGAAAATTAGCCACCGGTATTTCTGTGGATACTTTTGACGAGTATCTGAAGATTGCGGACACTACGGGGCGGCTATGCCTCAAGAAGTTTTGCAAAGCTTTCATCAAGGCATACAATGCCGAGTATCTTCGGCCTCCTACACTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803538.1
MQKELFLRIADGEYLLPHETRCYRPDSLTSLQKCTMVLRKLATGISVDTFDEYLKIADTTGRLCLKKFCKAFIKAYNAEYLRPPTLWMPHACFKCMSSGTNFLGCSGAWIACIGLERISQRCSMVHLQESPLFADALEGTTSPVIFQVNQRYYHMGYYLCGGIYPKWPTFVKSPLMASNAKEARFKKMQEAQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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