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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002873`

染色体: Chr03 坐标: 45395002-45407138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002873`
名称	SmilChr03G002873
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45395002 - 45407138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018869`
GeneID	`131018869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018869`
原始查询	`LOC131018869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.5; qcov=0.66; evalue=2.36e-81; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=31.1; qcov=0.547; evalue=9.02e-70; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803549.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803549.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803549.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803549.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45395028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:45395094`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B42,B91
`Chr3:45395094`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B42,B91
`Chr3:45395101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C24
`Chr3:45395181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B4
`Chr3:45395200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,D7
`Chr3:45395236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B125,B41,B48,C17
`Chr3:45395242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B12,B60
`Chr3:45395247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,D10
`Chr3:45395285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C48,C85
`Chr3:45395285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C85
`Chr3:45395295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B94,C45,C82,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803549.1

817 aa

408

817

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 161-255 aa PF10551 MULE 377-469 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803549.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	161	255	4.8e-18	66.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057803549.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	377	469	2e-26	92.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947566.1
ATGCCGTCCACTCCCACCACGTCCAGCTCGAAACGAAGCTCGATTCAAAGCTCAGTTACCCGCAAGCCCTGGCTCCGGGCGTCGCCTCCGCCTCCATTTGGAGTGGTGGCCTTGAGCTCTGGAACACCGTTCGTTACGGCAATCAATGGAGAAGTGATGCCTGGCCAGTGGGAATTCCAAGTCGGACCATCTGTTGGCATTTCAGCTGGAGACGAGCTGTGGATAGCTCGTTGCATATTGGAGAGGATCACTGAGATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018869
ATGCCGTCCACTCCCACCACGTCCAGCTCGAAACGAAGCTCGATTCAAAGCTCAGTTACCCGCAAGCCCTGGCTCCGGGCGTCGCCTCCGCCTCCATTTGGAGTGGTGGCCTTGAGCTCTGGAACACCGTTCGTTACGGCAATCAATGGAGAAGTGATGCCTGGCCAGTGGGAATTCCAAGTCGGACCATCTGTTGGCATTTCAGCTGGAGACGAGCTGTGGATAGCTCGTTGCATATTGGAGAGGATCACTGAGATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803549.1
MPSTPTTSSSKRSSIQSSVTRKPWLRASPPPPFGVVALSSGTPFVTAINGEVMPGQWEFQVGPSVGISAGDELWIARCILERITEIAGVVVSFDPKPIEISTIWKHSYKVGEWRPCISKSFEDDVNNHVAFRPPHSYLPICEDSKKPYVGKVFKTLDEAYEFYSMYGHAAGFDTRRGGIKRGKHRQVLYQYFICRREGVKPDSKKDISESSVQKKIRRRKPSTRNGCKARITATLNDDGNYVFTSFSELHNHSLVTEDVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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