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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002915`

染色体: Chr03 坐标: 45905305-45905967 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002915`
名称	SmilChr03G002915
描述	uncharacterized SmilChr03G002915
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45905305 - 45905967 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018877`
GeneID	`131018877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018877`
原始查询	`LOC131018877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=20.6; qcov=0.973; evalue=4.08e-06; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=25.5; qcov=0.964; evalue=9.43e-17; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803555.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803555.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803555.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803555.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45905317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B9,C39
`Chr3:45905344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:45905452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr3:45905491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C6,C75
`Chr3:45905518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B9,C39,D10
`Chr3:45905523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C39,D10
`Chr3:45905529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr3:45905566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B9,C39,D10
`Chr3:45905597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B114,B9,C39,D10
`Chr3:45905616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:45905632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr3:45905702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803555.1

220 aa

110

220

MULE

SWIM

PF10551 MULE 8-42 aa PF04434 SWIM 192-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803555.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	8	42	2.2e-08	35.0	MULE transposase domain
`XP_057803555.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	192	218	5.9e-06	26.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947572.1
ATGTGCTACAATCCTCCAGAAGGTCTCATGATTATGTCCGACCAGCATAAGAGTATCGAAAATGCTATTAGGTCTGTCTATCCAAATGCAACGCATGGATTGTGTTATCACCACTTGCATAAAAATTTGACACAAATTGGCAAGGAAGCATTAATTCACTTCAAGAATGCGGCATATGCTTATCGAGTTGAAGGTTTTGGAAAATTCTTTTCGGAGTTGGAGTTGCAAAGTCATAGCGCTCATACGAGGCTTTCCCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018877
ATGTGCTACAATCCTCCAGAAGGTCTCATGATTATGTCCGACCAGCATAAGAGTATCGAAAATGCTATTAGGTCTGTCTATCCAAATGCAACGCATGGATTGTGTTATCACCACTTGCATAAAAATTTGACACAAATTGGCAAGGAAGCATTAATTCACTTCAAGAATGCGGCATATGCTTATCGAGTTGAAGGTTTTGGAAAATTCTTTTCGGAGTTGGAGTTGCAAAGTCATAGCGCTCATACGAGGCTTTCCCTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803555.1
MCYNPPEGLMIMSDQHKSIENAIRSVYPNATHGLCYHHLHKNLTQIGKEALIHFKNAAYAYRVEGFGKFFSELELQSHSAHTRLSLIGVERWSRSRSPVPRYSFMTSNVADVLNSRLLWARRFPVSSLLETFRTIVEKWFDERWASAMSRQHELTEAAYNKLTVQVELDHHLRVYETTTHVYKVEEEKRIHQVDLVTRTCECREFDEDKILCRHDVAAIR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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