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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001567`

染色体: Chr01 坐标: 29680952-29683107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001567`
名称	SmilChr01G001567
描述	uncharacterized SmilChr01G001567
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29680952 - 29683107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018887`
GeneID	`131018887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018887`
原始查询	`LOC131018887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817035]; symbol=AT2G24960; hit=AT2G24960; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817035]; symbol=AT2G24960; hit=AT2G24960; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G24960` (AT2G24960) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817035] identity=26.7; qcov=0.397; evalue=1.76e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803566.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803566.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803566.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803566.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29681226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A16,A18,A19,A21,B1,B101,B109,B110,B124,B128,B129,B19,B27,B29,B33,B39,B4,B42,B43,B48,B49,B51,B61,B63,B68,B7,B71,B74,B75,B77,B8,B85,B87,B89,B92,B97,C1,C11,C17,C23,C34,C39,C42,C5,C50,C52,C53,C54,C56,C61,C7,C74,C8,C81,C84,D9
`Chr1:29681230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:29681232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:29681299`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B135,B82
`Chr1:29681299`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B135,B82
`Chr1:29681330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:29681347`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A1,A13,A4,A5,A9,B102,B107,B11,B115,B117,B119,B120,B131,B16,B17,B18,B2,B3,B33,B40,B41,B46,B58,B60,B65,B66,B70,B76,B86,B92,B95,C12,C15,C21,C28,C29,C30,C36,C41,C46,C5,C51,C55,C6,C60,C63,C66,C68,C7,C72,C74,C77,C86,C87,D4,D8
`Chr1:29681349`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A1,A13,A4,A5,A9,B102,B107,B11,B115,B117,B119,B120,B131,B16,B17,B18,B2,B3,B33,B40,B41,B46,B58,B60,B65,B66,B70,B76,B86,B92,B95,C12,C15,C21,C28,C29,C30,C36,C41,C46,C5,C51,C55,C6,C60,C63,C66,C68,C7,C72,C74,C77,C86,C87,D4,D8
`Chr1:29681377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B34,B86
`Chr1:29681423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:29681431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B49
`Chr1:29681447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803566.1

302 aa

151

302

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 73-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803566.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	73	166	6.2e-07	31.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947583.1
TCAAGCAGAATTTTGGGCGACAATAAAACAAAAGGATGTGATGGAGTTCAATCGAGAAAGTGAGAAGTGTTGCCTGCCGAGGGCCCGACGCTAGACTCTGCGTCGTCTTCGAAATTCAATTTCCGGGCTGCCGGGGTTTCACCGGATCGCATACGTCATGGTATGTGACGTCGGCACCGACTTCTTTGTTCAAGGCTTCCATCGTACATATACATGCATGTGGCGAATCGGCAGGATGCACTGGCTTACATTCCTCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018887
ATGGTATGTGACGTCGGCACCGACTTCTTTGTTCAAGGCTTCCATCGTACATATACATGCATGTGGCGAATCGGCAGGATGCACTGGCTTACATTCCTCTTCGCGCTCAACAAGACGCCTGATCAAATAGTCTTTCTCCATTTTCTTCTTGCATGTAATATCCACAAGATGTCCTTAACTAAAATTGATGCGCAATCGTTGTATATCTACGACGAACAATGGACTGCCAAGCATGACTCATTTCTGCTGGAGGCTTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803566.1
MVCDVGTDFFVQGFHRTYTCMWRIGRMHWLTFLFALNKTPDQIVFLHFLLACNIHKMSLTKIDAQSLYIYDEQWTAKHDSFLLEALLAKKDECSPVPPHKSFHAKLCVLDAFNRAFDTSIGLADIEERLAFLEGRHKTFKRISKQNGTHWDVDKNMVIASEVVWEKIIKDDEFAEAYFWKGEPEWRNLSLLFDPDTVKAEPSRSRNVIIISDSPTAKFEPSATIPLDSPYSEGEVTSPPFIAPPVCGSQRRLSFDGKIEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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