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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002999`

染色体: Chr03 坐标: 46806557-46811687 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002999`
名称	SmilChr03G002999
描述	uncharacterized SmilChr03G002999
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46806557 - 46811687 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018888`
GeneID	`131018888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018888`
原始查询	`LOC131018888`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803564.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803564.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803564.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803564.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803564.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46806770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:46806798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B132,C8
`Chr3:46806801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C19
`Chr3:46806838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B132,B16,C8
`Chr3:46806839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B46,C17,C57
`Chr3:46806850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:46806890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C8
`Chr3:46807360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:46807361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C69
`Chr3:46807378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:46807563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B30
`Chr3:46807572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803564.1

288 aa

144

288

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 86-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803564.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	86	223	5.8e-27	95.2	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947581.1
TTCAAATCTAACGTTCAAGTTTTTTCCCCCAATTAAAACCTAGTTTTTTCTCACTATTCCAGCCGCGACTGGTCTTCCATTTCTCCCACCGCCGTCCTCTCACCGGCGTCGCCACCGTCCTTGCTCGGACGCTCATCGTCGCAGCCGCCGTCGATTGGGATTGCACTGCCCTCGCCCAGCCCTACCCCGTCGCTCGACTCCATAGCTGCAACAATTGGGTGGTAGGATCACACAAGAAGATGTCTAGTGTGATTACCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018888
ATGTCTAGTGTGATTACCACATCTTTCAAGAAAGTGAAGAATCCAAATGGCTTTAATTGGAAATTAACTCCCAACAACATCAAAAAATTGTACTTTGATGAATTCAAAAAAGTGTACACATGGCCTGAAAAGTTTGAGAATCAAGTCTACAAAAAATGGTCTCAAAGGGCAGCCATGAGGTATAGCGACTTCGTGCACAACATGAAGTTAAAGAGGGATGATGCAGTTGAGGGAGGAGGTATGCCTGGATACATTGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803564.1
MSSVITTSFKKVKNPNGFNWKLTPNNIKKLYFDEFKKVYTWPEKFENQVYKKWSQRAAMRYSDFVHNMKLKRDDAVEGGGMPGYIDEDAWKDLCEYWDTESVKAKSEKARQCRLSEPDGPGTGIVKHKGGSKSVEDIAQELAAAKGVPVSSVIYDSFRALHVKKDGTYTDKKSERIDVEVQEIATEMGQSNPDTPVDMNKIYLDVLGGGLDKKQRLFGTGSLALTLKTNISGESSTSAMSDIDKEQYATRLGDVEEQLQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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