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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003018`

染色体: Chr03 坐标: 47089331-47090095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003018`
名称	SmilChr03G003018
描述	uncharacterized SmilChr03G003018
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47089331 - 47090095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018894`
GeneID	`131018894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018894`
原始查询	`LOC131018894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.7; qcov=0.736; evalue=3.26e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.1; qcov=0.854; evalue=1.55e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803570.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803570.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803570.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803570.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47089343`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A15,A16,A24,A3,A7,B1,B108,B113,B134,B136,B20,B72,B8,C14,C41,C43,C47,C71,C75,C80,C83,C9,D10,D7
`Chr3:47089347`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089347`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089352`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089352`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089354`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089354`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089363`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089363`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A15,B108,C71
`Chr3:47089393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B59,C45,C69,C74
`Chr3:47089398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr3:47089410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B45,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803570.1

254 aa

127

254

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 83-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803570.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	83	177	5.1e-18	66.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947587.1
ATGAAGATCAAACCGCTGAGATTTGTTTTTCCGAGGCTGTTTCATCTGTGTGATAACAAAGAGGTGTCAGTTGATGAGTCCGGATTGTGGGTTGATGGGAATTGGGAGTGGGTGTTCAACTGGAGAAGGGAACTGTTAAAGAGGGAGAAGGGGAGTGTTGAAGCGCTAACAGGTTTCCTTTCTCATCACATTCCATGTGCAGGAAAAACAGATGGATGGACGTGGAAGGCATCTAAGGAGGGGGTCTACACAACAAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018894
ATGAAGATCAAACCGCTGAGATTTGTTTTTCCGAGGCTGTTTCATCTGTGTGATAACAAAGAGGTGTCAGTTGATGAGTCCGGATTGTGGGTTGATGGGAATTGGGAGTGGGTGTTCAACTGGAGAAGGGAACTGTTAAAGAGGGAGAAGGGGAGTGTTGAAGCGCTAACAGGTTTCCTTTCTCATCACATTCCATGTGCAGGAAAAACAGATGGATGGACGTGGAAGGCATCTAAGGAGGGGGTCTACACAACAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803570.1
MKIKPLRFVFPRLFHLCDNKEVSVDESGLWVDGNWEWVFNWRRELLKREKGSVEALTGFLSHHIPCAGKTDGWTWKASKEGVYTTKSAYSVMAATKNVVPAAQDVNETLAAVWETPAPFKVRVTAWRCLRNRLATCDNLIKRNVAISTEESACNGCVSGVETVDHLFLLCPKVEQVWDGIQKWLGFSTVRPHNITHHFTSFTHLGRRKRSEKFLKTVWTCTIWLLWKRRNESRFDGKGWEVQMLIQEIKGRLWS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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