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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000127`

染色体: Chr01 坐标: 2140141-2140734 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000127`
名称	SmilChr01G000127
描述	uncharacterized SmilChr01G000127
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2140141 - 2140734 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018896`
GeneID	`131018896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018896`
原始查询	`LOC131018896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=29.9; qcov=0.883; evalue=1.96e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.7; qcov=1.01; evalue=2.53e-28; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806828.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806828.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806828.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806828.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2140157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr1:2140161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr1:2140177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B129,B19,B33,C61,C62
`Chr1:2140177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B19,B33,C61,C62
`Chr1:2140263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B99
`Chr1:2140335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:2140352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:2140374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	76	A1,A18,A20,A5,B104,B105,B106,B117,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B130,B132,B133,B138,B15,B17,B18,B24,B29,B30,B33,B34,B42,B43,B44,B47,B50,B51,B54,B55,B58,B61,B63,B64,B66,B74,B76,B79,B80,B85,B86,B88,B9,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C15,C19,C20,C21,C26,C28,C40,C45,C46,C50,C58,C6,C65,C69,C73,C86,C9,D10,D11,D4,D7
`Chr1:2140433`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A10,A18,A25,B101,B135,B26,B82,C7,C74,D6
`Chr1:2140568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C45
`Chr1:2140578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B91,C57
`Chr1:2140602`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A23,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806828.1

197 aa

197

SWIM

PF04434 SWIM 64-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806828.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	64	92	1e-08	35.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950845.1
ATGCTTGAGGATATAAGATGCTCCTCGATGGAAAGGCAGGTTAAGAAGTTGAGTATACTTGAAAATTGGGATGATTCTATCTGCCCACAAATTAGGAAAAATCTTGAAAATCTGAAAATACAGAGTAGGAACTGTCAAGTACATTCGGCCATATGTGGAAAATTTGAAGTTCATCACCATGATGACAAATTTGTGGTTGTGATAGAGTCTAGGGCATGCACATGTAGAGTTTGGGAATTAAATGGAATTCCATGTGTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018896
ATGCTTGAGGATATAAGATGCTCCTCGATGGAAAGGCAGGTTAAGAAGTTGAGTATACTTGAAAATTGGGATGATTCTATCTGCCCACAAATTAGGAAAAATCTTGAAAATCTGAAAATACAGAGTAGGAACTGTCAAGTACATTCGGCCATATGTGGAAAATTTGAAGTTCATCACCATGATGACAAATTTGTGGTTGTGATAGAGTCTAGGGCATGCACATGTAGAGTTTGGGAATTAAATGGAATTCCATGTGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806828.1
MLEDIRCSSMERQVKKLSILENWDDSICPQIRKNLENLKIQSRNCQVHSAICGKFEVHHHDDKFVVVIESRACTCRVWELNGIPCVHAIVALAFLKVDSVAYIHEYYTIERYKLAYTFGLEPLNGKKMCPDAEGYTVFPLHIRRMSGRPKLKRKRNSDEVNPNNTHKLKKNGVTMTCRRCMQPEHNTRTCKNEAVEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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