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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003040`

染色体: Chr03 坐标: 47297612-47299289 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003040`
名称	SmilChr03G003040
描述	nodulation receptor kinase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47297612 - 47299289 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018904`
GeneID	`131018904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018904`
原始查询	`LOC131018904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nodulation receptor kinase-like
产物	nodulation receptor kinase-like
Arabidopsis	`AT2G14510` (AT2G14510) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815938] identity=39.7; qcov=0.531; evalue=2.61e-15; confidence=low
Rice	`Os07g0568100` (SYMRK) - identity=36.7; qcov=0.352; evalue=5.35e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057803578.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803578.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057803578.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057803578.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803578.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47297615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B130,C29,C33,C55
`Chr3:47297627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C22
`Chr3:47297628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:47297652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:47297657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C61
`Chr3:47297657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:47297662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:47297696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C41
`Chr3:47297699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C22
`Chr3:47297716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:47297718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B12,B55,B66,D11
`Chr3:47297723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803578.1

256 aa

128

256

LRR_1

PF00560 LRR_1 200-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803578.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	200	216	0.00016	21.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947595.1
ATGGTCGTTGGATATCGGGCGTCGTGCGTCGGGCACGCAAGCTGTCGAGTGGGCGCATCGGGTGATTTCGAGCGTCTCACATCGGGAGTGCGGGGCACCGAGTACGGGCGTCGGGTGGGTGTCATGTGGCGGATGCACGCACACTACCGGACCAGCGCGTCGGGTGATGCCGGGCGCTGCGTGTCGGGTGTGCGGGGCGTCGGGGCACGGGTTGATATATGGGCTAGTGGTTCACGCTTCTTGGCAGTAGTTCTCAACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018904
ATGGTCGTTGGATATCGGGCGTCGTGCGTCGGGCACGCAAGCTGTCGAGTGGGCGCATCGGGTGATTTCGAGCGTCTCACATCGGGAGTGCGGGGCACCGAGTACGGGCGTCGGGTGGGTGTCATGTGGCGGATGCACGCACACTACCGGACCAGCGCGTCGGGTGATGCCGGGCGCTGCGTGTCGGGTGTGCGGGGCGTCGGGGCACGGGTTGATATATGGGCTAGTGGTTCACGCTTCTTGGCAGTAGTTCTCAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803578.1
MVVGYRASCVGHASCRVGASGDFERLTSGVRGTEYGRRVGVMWRMHAHYRTSASGDAGRCVSGVRGVGARVDIWASGSRFLAVVLNFTTNGVLNLTFIKALNSQLGPICNAYEILQVYPRNAETNVEEVEVIMKVKNELLAQNQDSEILKTWSGDLCLPLPWHGLSCDALNGTSIISKMDLSFSRLTGPLPSSITKLKYLKELNVSNNGFIGIVPQFPAFPIFQIFGQKLNYVQLYHTGFCSADNSPLPAHEGFAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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