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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003072`

染色体: Chr03 坐标: 47738570-47739205 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003072`
名称	SmilChr03G003072
描述	uncharacterized SmilChr03G003072
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47738570 - 47739205 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018912`
GeneID	`131018912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018912`
原始查询	`LOC131018912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003906 (DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity); GO:0008311 (double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803583.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803583.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803583.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803583.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47738588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B108,B71,C80
`Chr3:47738591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:47738642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	71	A1,A10,A16,A23,A5,A6,B1,B102,B108,B113,B121,B125,B135,B137,B15,B2,B22,B27,B29,B3,B31,B32,B36,B37,B38,B44,B48,B5,B54,B58,B65,B68,B73,B74,B75,B77,B78,B80,B84,B89,B94,C18,C19,C2,C26,C29,C31,C32,C36,C38,C42,C44,C45,C47,C48,C5,C51,C55,C58,C60,C62,C68,C72,C74,C79,C85,C87,D2,D4,D5,D8
`Chr3:47738643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B12,B55,B94,C28,C74
`Chr3:47738643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B94,C28,C74
`Chr3:47738719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B135,B48,C71
`Chr3:47738723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:47738728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B135,B48,C71
`Chr3:47738753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:47738754`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A5,B123,B132,B36,B43,B51,B59,B8,B91,C71,D9
`Chr3:47738756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47738813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803583.1

211 aa

106

211

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 4-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803583.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	208	3e-12	47.5	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947600.1
ATGATTGTTATTTCTTACAATATTAGAAGCTTGGGGAACATTGCTAAGCAGAGAGACTGTCGCGATCTTATCAGTTCGGAGAAAGCAGATTTGTGTTTTATTCAGGAGTCAAAACTGGAGGAATTTTCTGAATCTTTGTGCTATTCGTGGTGGGGCGCAAACAACTGTAAGTGGGCGGCGAGAAATTCGGAAGGCAGATCGGGGGGAATCTTGTGCGCCTGGAATAAAGATTTATTCTTTGTCTCCAGTAAGTGGGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018912
ATGATTGTTATTTCTTACAATATTAGAAGCTTGGGGAACATTGCTAAGCAGAGAGACTGTCGCGATCTTATCAGTTCGGAGAAAGCAGATTTGTGTTTTATTCAGGAGTCAAAACTGGAGGAATTTTCTGAATCTTTGTGCTATTCGTGGTGGGGCGCAAACAACTGTAAGTGGGCGGCGAGAAATTCGGAAGGCAGATCGGGGGGAATCTTGTGCGCCTGGAATAAAGATTTATTCTTTGTCTCCAGTAAGTGGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803583.1
MIVISYNIRSLGNIAKQRDCRDLISSEKADLCFIQESKLEEFSESLCYSWWGANNCKWAARNSEGRSGGILCAWNKDLFFVSSKWDFPGAVIIIGVWRPNNLRCCFVNVYAPSNPSEKHVLWDMIRVFVDQNKDLCLCVLGDFNAIRDPGERVGSGEPYGATETRLFDLFIRESELLEIRTQGRKFTWYQPNGRCKSKLDRFLVNKKWITE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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