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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003077`

染色体: Chr03 坐标: 47783923-47784459 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003077`
名称	SmilChr03G003077
描述	uncharacterized SmilChr03G003077
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47783923 - 47784459 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018914`
GeneID	`131018914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018914`
原始查询	`LOC131018914`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.4; qcov=0.64; evalue=6.7e-29; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=41.8; qcov=0.994; evalue=9.91e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803586.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803586.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803586.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803586.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47783934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B91,D4
`Chr3:47783935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B48,B58,C31
`Chr3:47783947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B111,B17
`Chr3:47783948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B111,B17,C69
`Chr3:47783957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B21,B55,C28,C74
`Chr3:47783958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B102,B111,B17,C53
`Chr3:47783964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B133,B53,C2,C29
`Chr3:47783976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B133,B53,C2,C29
`Chr3:47783982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B88,C45
`Chr3:47783985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,C24,D5
`Chr3:47784013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C3
`Chr3:47784018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803586.1

178 aa

178

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 2-113 aa PF13359 DDE_Tnp_4 21-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803586.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	113	2.6e-37	129.2	Plant transposon protein
`XP_057803586.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	21	104	1.4e-05	25.5	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947603.1
ATGTTGTTTAACGATCAACTAGAAGGAAGGGCTCCGCCGATCACATATCAAGTCAAAAACGCCTACTACACAAATGAGTACTACTTGACCGACAACATCTACGCCAATTGGCCTATTTTCGTGAAAAGTCCTACGCATCTGATGGACGCGAAGAGTAAGAAATTCAAGGTGATGCAGAAAGCGACTCGCAAGGATACCGAACAAACTTTTGGCGTGCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCATCAAAGAACCAGCCCGTCTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018914
ATGTTGTTTAACGATCAACTAGAAGGAAGGGCTCCGCCGATCACATATCAAGTCAAAAACGCCTACTACACAAATGAGTACTACTTGACCGACAACATCTACGCCAATTGGCCTATTTTCGTGAAAAGTCCTACGCATCTGATGGACGCGAAGAGTAAGAAATTCAAGGTGATGCAGAAAGCGACTCGCAAGGATACCGAACAAACTTTTGGCGTGCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCATCAAAGAACCAGCCCGTCTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803586.1
MLFNDQLEGRAPPITYQVKNAYYTNEYYLTDNIYANWPIFVKSPTHLMDAKSKKFKVMQKATRKDTEQTFGVLQARWAIIKEPARLWHKEELSDIIFTCIILHNMIIEDEGEHAMKWEEEVSDEASSSLAAAHPRTGAPSEFRAFVARQASMRDAEMHARLTLDLKEHIWSCFGPIKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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