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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003083`

染色体: Chr03 坐标: 47877677-47878446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003083`
名称	SmilChr03G003083
描述	uncharacterized SmilChr03G003083
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47877677 - 47878446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018915`
GeneID	`131018915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018915`
原始查询	`LOC131018915`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.5; qcov=0.903; evalue=1.67e-14; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=22.8; qcov=0.912; evalue=5.63e-14; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803587.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803587.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803587.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803587.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47877686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:47877707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D6
`Chr3:47877729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47877770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr3:47877792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B99,C77
`Chr3:47877908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:47877918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:47877945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C47
`Chr3:47877997`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A2,A5,B11,B115,B134,B137,B140,B33,B45,B51,B61,B70,C1,C15,C17,C19,C3,C4,C43,C50,C54,C55,C65,D1,D10,D8,D9
`Chr3:47878035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B28,B5,B85,C65
`Chr3:47878037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C47
`Chr3:47878052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B41,B75,C10,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803587.1

226 aa

113

226

SWIM

PF04434 SWIM 153-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803587.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	153	184	4.2e-09	36.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947604.1
ATGCAGAAGAATCTTGTGCATTATGGGAAACATCTTGTGGCAATATTTAAATCAGTAGCATATGCGTATAGATCTGAGGAGTTCCATAGGAATTTTACTGCGCTCCAAGTACTTAAGCCTACAGCACATAGACATTTATTCGATGTTGGGGAGCATAGGTGGGCTAGGTCGAAGTGCCTCGTACGACCTAGCAGTTTCATGACCTCGAATGCAGCGGAGTCTTTGAATAGTCATTTGTTGTGGGCTCGTTGTCTACCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018915
ATGCAGAAGAATCTTGTGCATTATGGGAAACATCTTGTGGCAATATTTAAATCAGTAGCATATGCGTATAGATCTGAGGAGTTCCATAGGAATTTTACTGCGCTCCAAGTACTTAAGCCTACAGCACATAGACATTTATTCGATGTTGGGGAGCATAGGTGGGCTAGGTCGAAGTGCCTCGTACGACCTAGCAGTTTCATGACCTCGAATGCAGCGGAGTCTTTGAATAGTCATTTGTTGTGGGCTCGTTGTCTACCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803587.1
MQKNLVHYGKHLVAIFKSVAYAYRSEEFHRNFTALQVLKPTAHRHLFDVGEHRWARSKCLVRPSSFMTSNAAESLNSHLLWARCLPICSLLECYRSIVEKWFDERHVSVIGISHQLTEKTALKLQVAVETGCHLIVCGTTTHMFTVEQENKSYVVDLQNLTCECKEFELDGIPCRHVCAAIRRVGLQVTDFVAKYFHQSSLMGTYLPHIRIVPHTLFDRPISWDGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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