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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003109`

染色体: Chr03 坐标: 48211684-48212583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003109`
名称	SmilChr03G003109
描述	uncharacterized SmilChr03G003109
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48211684 - 48212583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018919`
GeneID	`131018919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018919`
原始查询	`LOC131018919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G28150; symbol=AT5G28150; hit=AT5G28150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT5G28150; symbol=AT5G28150; hit=AT5G28150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G28150` (AT5G28150) - identity=51.2; qcov=1.01; evalue=3.6e-101; confidence=high
Rice	`Os03g0806700` - identity=48; qcov=1.01; evalue=7.33e-94; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05910 (DUF868)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803590.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803590.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803590.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803590.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803590.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48211786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:48211828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B98,C51,D4
`Chr3:48211947`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B33,B86
`Chr3:48211947`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B33,B86
`Chr3:48212052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:48212416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803590.1

299 aa

150

299

DUF868

PF05910 DUF868 27-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803590.1`	Pfam	`PF05910`	DUF868	Family	27	297	4.1e-91	306.1	Plant protein of unknown function (DUF868)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947607.1
ATGATGAAGGATTTCCCATCTTGTTTTGGTGAAAATGGAGTTCAAGTTGCAGATTCATCACCATCAACCACAAACAGAGCTCAGAATCTTGTTGCCTGCATCTACCAATACCACTCTCAGTCCTTCTCTGGCTTCATCACAGTCACATGGATCAAGAATATCATGGCCCAGGCATTGAGCATCGCGGTCGAGAACTCAGCCAACGACAGCCTAGGCAAAGTGGACATAAGGCCATGGCTCTTCTCAAAGAGAAAAGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018919
ATGATGAAGGATTTCCCATCTTGTTTTGGTGAAAATGGAGTTCAAGTTGCAGATTCATCACCATCAACCACAAACAGAGCTCAGAATCTTGTTGCCTGCATCTACCAATACCACTCTCAGTCCTTCTCTGGCTTCATCACAGTCACATGGATCAAGAATATCATGGCCCAGGCATTGAGCATCGCGGTCGAGAACTCAGCCAACGACAGCCTAGGCAAAGTGGACATAAGGCCATGGCTCTTCTCAAAGAGAAAAGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803590.1
MMKDFPSCFGENGVQVADSSPSTTNRAQNLVACIYQYHSQSFSGFITVTWIKNIMAQALSIAVENSANDSLGKVDIRPWLFSKRKGFKKMVVDSTQVDIYWDLSSAKFGSSPEPLEGFYLAIALNQELCLLLGDLQTEAYKKIDPSPFASKATFLARKEHIFGKRLYNSKAQFCGKGRVHDIRIEFDPNESFGKCLTMFVDRKAVLQVTHLQWKFRGNQTIFVDGVCVEVYWDVHGWLFDSEAGSAIFLFRTQVSGAKAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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