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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003166`

染色体: Chr03 坐标: 49024490-49025209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003166`
名称	SmilChr03G003166
描述	uncharacterized SmilChr03G003166
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49024490 - 49025209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018929`
GeneID	`131018929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018929`
原始查询	`LOC131018929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=23.8; qcov=0.875; evalue=1.52e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.2; qcov=0.884; evalue=8.81e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803597.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803597.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803597.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803597.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49024588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A21,B102,B118,B122,B20,B33,B44,B91,C1
`Chr3:49024607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B19,C64,C66
`Chr3:49024614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B137,C24,C73
`Chr3:49024623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B115,C77
`Chr3:49024649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:49024654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B33,B56,B96,D4
`Chr3:49024684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B87
`Chr3:49024716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:49024758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B117
`Chr3:49024797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B137,B51,C17
`Chr3:49024800`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B37,B54,B90,C3
`Chr3:49024800`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B37,B54,B90,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803597.1

216 aa

108

216

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 18-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803597.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	18	112	6.5e-17	62.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947614.1
ATGTCAGGTAATAGAGAAAGGTGGATCTGGAAAGCTTCCAAAGGTGGTGACTATACAACAAAATCCGCTTACTCGGCGATCAAGGCTTCTCGCAACGAGAGCACTTCGACAATTAGCAACAGCGACACATTGGCTAGTATCTGGACTACAACAGCAACTCATAAAGCCAAAGTTACAGCTTGGAGGATTTTGCGAAGCAGATTACCAACTTGTGACAATCTGAGGAAGAGGAACGTGCCGTTGGGTGTGGAGGAAATGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018929
ATGTCAGGTAATAGAGAAAGGTGGATCTGGAAAGCTTCCAAAGGTGGTGACTATACAACAAAATCCGCTTACTCGGCGATCAAGGCTTCTCGCAACGAGAGCACTTCGACAATTAGCAACAGCGACACATTGGCTAGTATCTGGACTACAACAGCAACTCATAAAGCCAAAGTTACAGCTTGGAGGATTTTGCGAAGCAGATTACCAACTTGTGACAATCTGAGGAAGAGGAACGTGCCGTTGGGTGTGGAGGAAATGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803597.1
MSGNRERWIWKASKGGDYTTKSAYSAIKASRNESTSTISNSDTLASIWTTTATHKAKVTAWRILRSRLPTCDNLRKRNVPLGVEEMTCNSCFHSPESVEHVFLTCPKTVMVWNRVKTWIGSRPAHPQGIDSHFYTFTHLDKGKNCENFLKALWICTTWLIWKRRNETRFEGKQWSIDGLILEIQARTWSWNKVFMFSRKDFSFRDWSSNELLAKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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