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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001578`

染色体: Chr01 坐标: 29805559-29806959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001578`
名称	SmilChr01G001578
描述	probable plastid-lipid-associated protein 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29805559 - 29806959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018947`
GeneID	`131018947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018947`
原始查询	`LOC131018947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable plastid-lipid-associated protein 4, chloroplastic
产物	probable plastid-lipid-associated protein 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G26070` (AT3G26070) Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822204] identity=61.6; qcov=0.734; evalue=6.73e-60; confidence=high
Rice	`Os03g0704100` - identity=58.2; qcov=0.794; evalue=8.03e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057803615.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057803615.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057803615.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057803615.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29806108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B37,B51,B63,C24
`Chr1:29806661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B71
`Chr1:29806788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B126,B89,C8,D5
`Chr1:29806790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B126,B89,C8,D5
`Chr1:29806795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B126,B89,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803615.1

241 aa

120

241

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 71-230 aa

XP_057803618.1

199 aa

100

199

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 71-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803615.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	71	230	7.1e-40	137.8	PAP_fibrillin
`XP_057803618.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	71	187	6e-28	98.9	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947632.1
AACAATACATTGTGTAACATTGTGAGCGAAACAGAGAGTGAAACCACATCCACCACACTCCCATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCAGCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCACCCCTCAGCCGCCGCCCCTTTTCCGGCCAATCACCACAGCAGCTCTCTGTCAACTCCAGCAGCTGTGCATAAATGGAGGGCAAATGTCTCCTTCTTCACTGGTTTGCTCAACAACAACAACAAGGCC...

XM_057947635.1
AACATTGTGAGCGAAACAGAGAGTGAAACCACATCCACCACACTCCCATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCAGCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCACCCCTCAGCCGCCGCCCCTTTTCCGGCCAATCACCACAGCAGCTCTCTGTCAACTCCAGCAGCTGTGCATAAATGGAGGGCAAATGTCTCCTTCTTCACTGGTTTGCTCAACAACAACAACAAGGCCAAGAACGCTGAAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131018947
ATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCAGCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCACCCCTCAGCCGCCGCCCCTTTTCCGGCCAATCACCACAGCAGCTCTCTGTCAACTCCAGCAGCTGTGCATAAATGGAGGGCAAATGTCTCCTTCTTCACTGGTTTGCTCAACAACAACAACAAGGCCAAGAACGCTGAAGCCATCAAGCAAGAGCTTCTAGAAGCCATCGACCCGCTCGATCGCGGTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803615.1
MALSTLSPAFTTHSTSSFLPNLHHPSAAAPFPANHHSSSLSTPAAVHKWRANVSFFTGLLNNNNKAKNAEAIKQELLEAIDPLDRGAEATPQDQKFIDQIVRKLEAANPTKEPLKSDLLNGKWELIYTTSQSILQTTRPKLLRSRRNFQAINADTLRAQNMESAPFFNQVTADLTPLNAKKVAVKFDFFKIGGLIPVKAPESAVGELEITYLDQDLRVSRGDKGNLFVLKMVDPSYRIPSK

XP_057803618.1
MALSTLSPAFTTHSTSSFLPNLHHPSAAAPFPANHHSSSLSTPAAVHKWRANVSFFTGLLNNNNKAKNAEAIKQELLEAIDPLDRGAEATPQDQKFIDQIVRKLEAANPTKEPLKSDLLNGKWELIYTTSQSILQTTRPKLLRSRRNFQAINADTLRAQNMESAPFFNQVTADLTPLNAKKVAVKFDFFKIGGLLLRVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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