当前解析结果
SmilChr03G003278| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003278 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003278 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003278 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 50776229 - 50776918 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018948 |
|---|---|
| GeneID | 131018948 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018948 |
| 原始查询 | LOC131018948 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018948 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057803613.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057803613.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803613.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803613.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803613.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:50776278 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A9,B25,B88,C31 |
Chr3:50776291 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A10,B119,B39,B85,C86 |
Chr3:50776291 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B119,B39,B85,C86 |
Chr3:50776293 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B104,B106,C48,C59 |
Chr3:50776293 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B104,B106,C48,C59 |
Chr3:50776301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B130,B23,B30,B58,B68,C18,C62,C80 |
Chr3:50776302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 48 | A14,A19,A2,B102,B103,B106,B11,B111,B115,B117,B119,B127,B131,B132,B134,B135,B138,B18,B25,B31,B38,B50,B51,B63,B64,B65,B69,B77,B80,B81,B90,B91,B92,B93,C1,C22,C34,C51,C58,C61,C72,C77,C82,C83,C85,D10,D4,D9 |
Chr3:50776327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B126,B137,B19,C19,C48,C50,C60,C65,C68,C71,D7 |
Chr3:50776329 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B46,B69,B70,B78,C38 |
Chr3:50776345 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr3:50776368 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C21,D1 |
Chr3:50776368 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | C21,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。