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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003292`

染色体: Chr03 坐标: 51037049-51038148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003292`
名称	SmilChr03G003292
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51037049 - 51038148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018954`
GeneID	`131018954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018954`
原始查询	`LOC131018954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=29.1; qcov=0.745; evalue=2.32e-22; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803621.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803621.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803621.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803621.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51037140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B15,B66,C22
`Chr3:51037179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:51037393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A25,B100,B132,B18,B22,B25,B29,B35,B36,B44,B45,B51,B56,B58,B6,B70,B75,B77,B85,B87,B96,C14,C17,C26,C32,C33,C4,C43,C47,C53,C54,C57,C65,C67,C68,C8,D10
`Chr3:51037455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:51037472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51037526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B15,B66
`Chr3:51037803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51037859`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr3:51037859`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr3:51037932`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B65,B72
`Chr3:51037932`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B65,B72
`Chr3:51037987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803621.1

337 aa

168

337

Transferase

PF02458 Transferase 108-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803621.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	108	320	1.2e-14	54.5	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947638.1
ATGTCTGTCGCCTATGAATTTGGCTGTTCTTCTGTTCTATCAATCGAAACCGGAATCAGGCATTGGCCAAAACCTTGGTGGATTTCTACCCGCTTGCTGGAAGATACATCAAGGATGAGAACCGTGTCGACTGCAACGATGAGAGCAGAAGCTCTCGACGTCGAGCTCGTAGATCTCATCGGGAAAAGCCACCCTCGTCATCGCCGTCAGCGTTTCGCACAGGATTTTCGACATACCTTCCATCACCACCTTCATTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018954
ATGTCTGTCGCCTATGAATTTGGCTGTTCTTCTGTTCTATCAATCGAAACCGGAATCAGGCATTGGCCAAAACCTTGGTGGATTTCTACCCGCTTGCTGGAAGATACATCAAGGATGAGAACCGTGTCGACTGCAACGATGAGAGCAGAAGCTCTCGACGTCGAGCTCGTAGATCTCATCGGGAAAAGCCACCCTCGTCATCGCCGTCAGCGTTTCGCACAGGATTTTCGACATACCTTCCATCACCACCTTCATTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803621.1
MSVAYEFGCSSVLSIETGIRHWPKPWWISTRLLEDTSRMRTVSTATMRAEALDVELVDLIGKSHPRHRRQRFAQDFRHTFHHHLHFQINWFKSPRLSALRLYSPAKITKASSADGPKIVAKRLLFDKAALTTLKSKIRPETTSGSQVVSAVIAKALIGVDRAKHGKSRDFVVFQPINMRERTIPPQSKHICANLTFTTLTPEEMGVQELVDVIGDGVRNTVAELAGVLSPYRDGREIIMKSLGSMMKAFQNQETKFIAFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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