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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001580`

染色体: Chr01 坐标: 29813831-29815328 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001580`
名称	SmilChr01G001580
描述	probable plastid-lipid-associated protein 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29813831 - 29815328 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018957`
GeneID	`131018957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018957`
原始查询	`LOC131018957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable plastid-lipid-associated protein 4, chloroplastic
产物	probable plastid-lipid-associated protein 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G26070` (AT3G26070) Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822204] identity=62.3; qcov=0.737; evalue=3.38e-60; confidence=high
Rice	`Os03g0704100` - identity=58.2; qcov=0.798; evalue=1.03e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057803627.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057803627.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057803627.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057803627.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29814049`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	101	A16,A19,A2,A22,A23,A5,B1,B10,B101,B103,B104,B106,B108,B111,B115,B118,B120,B123,B125,B127,B132,B134,B135,B136,B15,B2,B22,B23,B24,B26,B28,B29,B32,B35,B4,B42,B43,B44,B46,B49,B53,B54,B55,B6,B60,B62,B64,B7,B74,B77,B78,B79,B80,B85,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C12,C13,C14,C16,C17,C19,C2,C22,C25,C26,C27,C28,C33,C35,C36,C39,C40,C41,C44,C46,C48,C5,C52,C55,C57,C60,C61,C76,C8,C80,C82,C83,C84,C86,D10,D3
`Chr1:29814715`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr1:29814715`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr1:29814961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:29815093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:29815094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803627.1

240 aa

120

240

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 70-229 aa

XP_057803631.1

198 aa

198

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 70-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803627.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	70	229	2.1e-40	139.5	PAP_fibrillin
`XP_057803631.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	70	186	1.6e-28	100.7	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947644.1
GTTCACGTTATAACTAAATATTTTTTATTTTTCAAATCCAAAAGTAATAAATATGAAGAAGATTGAAAAGAAAAAGCAACAATTTTTATGGGTGGACGAAATTGATGAACAATTTGTGTAACCTTGTGAGCGAAACACAGAGTGAAACCACATCCACCACACTCCCATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCACCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCCCTCCGCCGCCGTCCCCTTTCCGG...

XM_057947648.1
TTTTTTATTTTTCAAATCCAAAAGTAATAAATATGAAGAAGATTGAAAAGAAAAAGCAACAATTTTTATGGGTGGACGAAATTGATGAACAATTTGTGTAACCTTGTGAGCGAAACACAGAGTGAAACCACATCCACCACACTCCCATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCACCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCCCTCCGCCGCCGTCCCCTTTCCGGCCAATTACCATAACAGCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131018957
ATGGCCTTATCCACTCTCTCTCCACCCTTCACCACTCACTCCACCTCCTCCTTCCTCCCCAACCTCCACCCCTCCGCCGCCGTCCCCTTTCCGGCCAATTACCATAACAGCTCTCTGTCAACTCCAGCAGCTGTGCATAAATGGAGGGCAAACGTCTCCTTCTTCACTGGTTTGCTCAACAACAACAACAAGGCCAAGAACGCCGAAGCCATCAAGCAAGAGCTACTAGAAGCCATCGAGCCCCTCGATCGCGGTGCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803627.1
MALSTLSPPFTTHSTSSFLPNLHPSAAVPFPANYHNSSLSTPAAVHKWRANVSFFTGLLNNNNKAKNAEAIKQELLEAIEPLDRGAEATPQDQKLIDQIVRKLEAANPTKEPLKSDLLNGKWELIYTTSQSILQTTRPKLLRSRRNFQAINADTLRAQNMESAPFFNQVTADLTPLNAKKVAVKFDFFKIGGLIPVKAPESAVGELEITYLDQDLRVSRGDKGNLFVLKMVDPSYRIPSK

XP_057803631.1
MALSTLSPPFTTHSTSSFLPNLHPSAAVPFPANYHNSSLSTPAAVHKWRANVSFFTGLLNNNNKAKNAEAIKQELLEAIEPLDRGAEATPQDQKLIDQIVRKLEAANPTKEPLKSDLLNGKWELIYTTSQSILQTTRPKLLRSRRNFQAINADTLRAQNMESAPFFNQVTADLTPLNAKKVAVKFDFFKIGGLLLRVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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