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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003339`

染色体: Chr03 坐标: 51680126-51680989 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003339`
名称	SmilChr03G003339
描述	uncharacterized SmilChr03G003339
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51680126 - 51680989 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018962`
GeneID	`131018962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018962`
原始查询	`LOC131018962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G21000` (AT3G21000) Gag-Pol-related retrotransposon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821651] identity=28.7; qcov=0.555; evalue=1.13e-07; confidence=low
Rice	`Os08g0125300` - identity=30.6; qcov=0.538; evalue=9.77e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF22936 (Pol_BBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803629.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803629.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803629.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803629.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51680211`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr3:51680211`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr3:51680254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C2,C30,C36
`Chr3:51680259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C2,C61
`Chr3:51680287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C43,C55,D8
`Chr3:51680304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51680358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:51680435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B48,C78,D2,D5
`Chr3:51680481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C58,C85,D3
`Chr3:51680519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C2,C61
`Chr3:51680715`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A13,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A4,A5,A6,A7,B103,B106,B107,B110,B120,B124,B127,B130,B136,B139,B140,B17,B2,B21,B22,B23,B26,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B45,B50,B54,B60,B61,B62,B65,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B8,B80,B81,B86,B91,B94,B97,C1,C17,C20,C24,C25,C28,C29,C30,C32,C35,C37,C40,C42,C45,C46,C48,C5,C52,C56,C58,C6,C60,C62,C68,C7,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C81,C84,C87,D7
`Chr3:51680761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B48,C78,D2,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803629.1

182 aa

182

Pol_BBD

PF22936 Pol_BBD 88-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803629.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	88	168	2.8e-27	95.6	Pol polyprotein, beta-barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947646.1
ATGAAGAAGAATGAAAGGATCACTTTAATGGAGAAGGCTCATAGTGCTTTGATTCTCTGTTTAAGTGACAAGGTGCTGCAAGAGAGAAAGACAATTTCTCTTGAGGAGGTCCAGGCTGCATTGAAAACCAAAGAATTGCAGAAGAGCAATTCAAAGAAGAAGCAAGCAGATGAAGGGCAAAATGGAAATGAGGCTGGTGTAGTGGAACACATTCAAGAAGCTAAAATCCCAAATGTGATGGAGCGCAAAATGGCAGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018962
ATGAAGAAGAATGAAAGGATCACTTTAATGGAGAAGGCTCATAGTGCTTTGATTCTCTGTTTAAGTGACAAGGTGCTGCAAGAGAGAAAGACAATTTCTCTTGAGGAGGTCCAGGCTGCATTGAAAACCAAAGAATTGCAGAAGAGCAATTCAAAGAAGAAGCAAGCAGATGAAGGGCAAAATGGAAATGAGGCTGGTGTAGTGGAACACATTCAAGAAGCTAAAATCCCAAATGTGATGGAGCGCAAAATGGCAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803629.1
MKKNERITLMEKAHSALILCLSDKVLQERKTISLEEVQAALKTKELQKSNSKKKQADEGQNGNEAGVVEHIQEAKIPNVMERKMADDWIMDSGCSFHMSPHKEWFSNLNGGEYGQVFLRNDHPRKVMGVGDIRLKLADGSVKILSKVRYIPDLKRNLISLGILESKGCHFVSKDGIMNVIKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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