当前解析结果
SmilChr03G003370| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003370 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003370 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003370 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52052166 - 52053913 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018967 |
|---|---|
| GeneID | 131018967 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018967 |
| 原始查询 | LOC131018967 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018967 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803634.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057803634.1 |
| 3 | PML body | PML body | 0.80000 | XP_057803634.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.60000 | XP_057803634.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057803634.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52052918 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,B47 |
Chr3:52052939 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr3:52052945 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr3:52052979 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:52053020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B48 |
Chr3:52053040 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:52053049 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr3:52053064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C51 |
Chr3:52053064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr3:52053073 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr3:52053102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B17,B62,B94,C38 |
Chr3:52053112 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,C50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。